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Enregistrement W2803559577 · doi:10.1002/path.5101

Functional molecules in mesothelial‐to‐mesenchymal transition revealed by transcriptome analyses

2018· article· en· W2803559577 sur OpenAlexfundno aff
Sara Namvar, Adrian S. Woolf, Leo Zeef, Thomas P. Wilm, Bettina Wilm, Sarah E. Herrick

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Pathology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParathyroid Disorders and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilMedical Research CouncilKidney Research UKMedical Research Council CanadaUniversity of ManchesterWellcome TrustMcMaster University
Mots-clésMesothelial CellImmunostainingEpithelial–mesenchymal transitionPeritoneal dialysisCell biologyFibrosisTranscriptomeCancer researchPathologyPeritoneumTransforming growth factorBiologyDownregulation and upregulationMedicineInternal medicineImmunohistochemistryGene expressionGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Peritoneal fibrosis is a common complication of abdominal and pelvic surgery, and can also be triggered by peritoneal dialysis, resulting in treatment failure. In these settings, fibrosis is driven by activated myofibroblasts that are considered to be partly derived by mesothelial-to-mesenchymal transition (MMT). We hypothesized that, if the molecular signature of MMT could be better defined, these insights could be exploited to block this pathological cellular transition. Rat peritoneal mesothelial cells were purified by the use of an antibody against HBME1, a protein present on mesothelial cell microvilli, and streptavidin nanobead technology. After exposure of sorted cells to a well-known mediator of MMT, transforming growth factor (TGF)-β1, RNA sequencing was undertaken to define the transcriptomes of mesothelial cells before and during early-phase MMT. MMT was associated with dysregulation of transcripts encoding molecules involved in insulin-like growth factor (IGF) and bone morphogenetic protein (BMP) signalling. The application of either recombinant BMP4 or IGF-binding protein 4 (IGFBP4) ameliorated TGF-β1-induced MMT in culture, as judged from the retention of epithelial morphological and molecular phenotypes, and reduced migration. Furthermore, peritoneal tissue from peritoneal dialysis patients showed less prominent immunostaining than control tissue for IGFBP4 and BMP4 on the peritoneal surface. In a mouse model of TGF-β1-induced peritoneal thickening, BMP4 immunostaining on the peritoneal surface was attenuated as compared with healthy controls. Finally, genetic lineage tracing of mesothelial cells was used in mice with peritoneal injury. In this model, administration of BMP4 ameliorated the injury-induced shape change and migration of mesothelial cells. Our findings demonstrate a distinctive MMT signature, and highlight the therapeutic potential for BMP4, and possibly IGFBP4, to reduce MMT. © 2018 The Authors. The Journal of Pathology published by John Wiley & Sons Ltd on behalf of Pathological Society of Great Britain and Ireland.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,893
Score d'incertitude au seuil0,239

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,342
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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