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Enregistrement W2803644870 · doi:10.1186/s13053-018-0089-x

Frequency of BRCA1 and BRCA2 causative founder variants in ovarian cancer patients in South-East Poland

2018· article· en· W2803644870 sur OpenAlexaff
Tomasz Kluz, Andrzej Jasiewicz, Elżbieta Marczyk, Robert Jach, Anna Jakubowska, Jan Lubiński, Steven A. Narod, Jacek Gronwald

Notice bibliographique

RevueHereditary Cancer in Clinical Practice · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensWomen's College Hospital
Organismes subventionnairesBreast Cancer Campaign
Mots-clésFounder effectOvarian cancerMedicineMutationCancerGeneticsInternal medicineOncologyBiologyGeneHaplotypeGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Causative variants in BRCA1 and BRCA2 are well-established risk factors for breast and ovarian cancer. In Poland, the causative founder variants in the BRCA1 are responsible for a significant proportion of ovarian cancer cases, however, regional differences in the frequencies of various mutations may exist. The spectrum and frequency of BRCA1/2 mutations between ovarian cancer patients have not yet been studied in the region of South-East Poland. We examined 158 consecutive unselected cases of ovarian cancer patients from the region of Podkarpacie. We studied 13 Polish causative founder variants in BRCA1 (c.5266dupC, c.4035delA, c.5251C > T, c.181 T > G, c.676delT, c.68_69delAG, c.3700_3704delGTAAA, c.1687C > T, c.3756_3759delGTCT) and in BRCA2 (c.658_659delGT, c.7910_7914delCCTTT, c.3847_3848delGT, c.5946delT). A BRCA1 causative founder variants were detected in 10 of the 158 (6.3%) ovarian cancer cases. BRCA2 causative founder variants were not observed. The c.5266dupC mutation was detected in 6 patients, c.181 T > G mutation in 3 patients and the c.676delT mutation in 1 patient. The median age of diagnosis of the 10 hereditary ovarian cancers was 55.5 years of age. The frequency of 13 causative founder variants in Podkarpacie was lower than in other regions of Poland. Testing of three BRCA1 mutations (c.5266dupC, c.181 T > G, c.676delT) should be considered a sensitive test panel.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,038
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,389
Écart entre enseignants0,346 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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