Characterization of the Binding Sites for Bacterial Acyl Homoserine Lactones (AHLs) on Human Bitter Taste Receptors (T2Rs)
Notice bibliographique
Résumé
The 25 bitter taste receptors (T2Rs) in humans are novel players in mediating host-pathogen responses in the airways and innate immunity. The chemosensory T2Rs are expressed in different extraoral tissues and perform diverse pathophysiological roles from mediating bronchodilation to detecting bacterial infection in the airways. T2Rs were suggested to be activated by multiple bacterial quorum sensing molecules (QSMs). However, whether bacterial QSMs bind to T2Rs and the structural features on T2Rs has not yet been characterized. Here, we analyzed the taste sensory profiles of QSMs including acyl homoserine lactones (C4-AHL, C8-AHL, and 3-oxo-C12-AHL) and hydroxyquinolones (HHQ and NHQ) predominantly secreted by Gram-negative bacteria and characterized the candidate T2Rs interacting with different QSMs using structure-function approaches. The potency of the above QSMs for T2Rs significantly expressed in the airways, namely T2R4, T2R14, and T2R20, was characterized. 3-Oxo-C12-AHL activated T2R4, T2R14, and T2R20, while C8-AHL activated T2R4 and T2R14 with strong potency. The T2R amino acid residues involved in the interactions were characterized by molecular-model-guided site-directed mutagenesis. AHLs bind to a similar orthosteric site present on the extracellular surface in all three T2Rs with significant contributions from residues in extracellular loop 2. Our results reveal the mode of binding of AHLs for different T2Rs and provide biochemical insights into their interactions. This study will facilitate mechanistic studies aimed at understanding the role of these T2Rs as "sensors" of bacteria and in host-pathogen interactions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».