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Enregistrement W2803982612 · doi:10.1128/mbio.00819-18

SAMHD1 Phosphorylation Coordinates the Anti-HIV-1 Response by Diverse Interferons and Tyrosine Kinase Inhibition

2018· article· en· W2803982612 sur OpenAlexaff
Matthew A. Szaniawski, Adam M. Spivak, James E. Cox, J. Leon Catrow, Timothy M. Hanley, Elizabeth S. C. P. Williams, Michel J. Tremblay, Alberto Bosque, Vicente Planelles

Notice bibliographique

RevuemBio · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteDoris Duke Charitable Foundation
Mots-clésSAMHD1Cyclin-dependent kinase 1Small interfering RNAKinaseDephosphorylationPhosphorylationTyrosine kinaseBiologyKinomeCell biologySignal transductionBiochemistryReverse transcriptaseCell cultureTransfectionCell cycleRNAGeneticsCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Macrophages are susceptible to human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) infection despite abundant expression of antiviral proteins. Perhaps the most important antiviral protein is the restriction factor sterile alpha motif domain and histidine/aspartic acid domain-containing protein 1 (SAMHD1). We investigated the role of SAMHD1 and its phospho-dependent regulation in the context of HIV-1 infection in primary human monocyte-derived macrophages and the ability of various interferons (IFNs) and pharmacologic agents to modulate SAMHD1. Here we show that stimulation by type I, type II, and to a lesser degree, type III interferons share activation of SAMHD1 via dephosphorylation at threonine-592 as a consequence of signaling. Cyclin-dependent kinase 1 (CDK1), a known effector kinase for SAMHD1, was downregulated at the protein level by all IFN types tested. Pharmacologic inhibition or small interfering RNA (siRNA)-mediated knockdown of CDK1 phenocopied the effects of IFN on SAMHD1. A panel of FDA-approved tyrosine kinase inhibitors potently induced activation of SAMHD1 and subsequent HIV-1 inhibition. The viral restriction imposed via IFNs or dasatinib could be overcome through depletion of SAMHD1, indicating that their effects are exerted primarily through this pathway. Our results demonstrate that SAMHD1 activation, but not transcriptional upregulation or protein induction, is the predominant mechanism of HIV-1 restriction induced by type I, type II, and type III IFN signaling in macrophages. Furthermore, SAMHD1 activation presents a pharmacologically actionable target through which HIV-1 infection can be subverted. IMPORTANCE Our experimental results demonstrate that SAMHD1 dephosphorylation at threonine-592 represents a central mechanism of HIV-1 restriction that is common to the three known families of IFNs. While IFN types I and II were potent inhibitors of HIV-1, type III IFN showed modest to undetectable activity. Regulation of SAMHD1 by IFNs involved changes in phosphorylation status but not in protein levels. Phosphorylation of SAMHD1 in macrophages occurred at least in part via CDK1. Tyrosine kinase inhibitors similarly induced SAMHD1 dephosphorylation, which protects macrophages from HIV-1 in a SAMHD1-dependent manner. SAMHD1 is a critical restriction factor regulating HIV-1 infection of macrophages.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,053
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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