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Enregistrement W2804342937 · doi:10.1111/jse.12427

A new phylogenetic tribal classification of the grape family (Vitaceae)

2018· article· en· W2804342937 sur OpenAlexaff
Jun Wen, Limin Lu, Ze‐Long Nie, Xiu‐Qun Liu, Ning Zhang, Stefanie M. Ickert‐Bond, Jean M. Gerrath, Steven R. Manchester, John K. Boggan, Zhiduan Chen

Notice bibliographique

RevueJournal of Systematics and Evolution · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueHorticultural and Viticultural Research
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNational Science Foundation of Sri LankaNational Museum of Natural HistoryCAS-SAFEA International Partnership Program for Creative Research TeamsSmithsonian InstitutionNational Science Foundation
Mots-clésVitaceaeGenusBiologyTribeBotanyPhylogenetic treeCladeZoologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Vitaceae (the grape family) consist of 16 genera and ca. 950 species primarily distributed in tropical regions. The family is well‐known for the economic importance of grapes, and is also ecologically significant with many species as dominant climbers in tropical and temperate forests. Recent phylogenetic and phylogenomic analyses of sequence data from all three genomes have supported five major clades within Vitaceae: (i) the clade of Ampelopsis , Nekemias , Rhoicissus , and Clematicissus ; (ii) the Cissus clade; (iii) the clade of Cayratia , Causonis , Cyphostemma , Pseudocayratia , Tetrastigma , and an undescribed genus “ Afrocayratia ”; (iv) the clade of Parthenocissus and Yua ; and (v) the grape genus Vitis and its close tropical relatives Ampelocissus , Pterisanthes and Nothocissus , with Nothocissus and Pterisanthes nested within Ampelocissus . Based on the phylogenetic and morphological (mostly inflorescence, floral and seed characters) evidence, the new classification places the 950 species and 16 genera into five tribes: (i) tribe Ampelopsideae J.Wen & Z.L.Nie, trib. nov. (47 species in four genera; Ampelopsis , Nekemias , Rhoicissus and Clematicissus ); (ii) tribe Cisseae Rchb. (300 species in one genus; Cissus ); (iii) tribe Cayratieae J.Wen & L.M.Lu, trib. nov. (370 species in seven genera; Cayratia , Causonis , “ Afrocayratia ”, Pseudocayratia , Acareosperma , Cyphostemma and Tetrastigma ); (iv) tribe Parthenocisseae J.Wen & Z.D.Chen, trib. nov. (ca. 16 spp. in two genera; Parthenocissus and Yua ); and (v) tribe Viteae Dumort. (ca. 190 species in two genera; Ampelocissus and Vitis ).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations118
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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