The <i>Pseudomonas aeruginosa</i> PilSR two-component system regulates both twitching and swimming motilities
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Motility is an important virulence trait for many bacterial pathogens, allowing them to position themselves in appropriate locations at appropriate times. Motility structures - pili and flagella - are also involved in sensing surface contact, which modulates pathogenicity. In Pseudomonas aeruginosa , the PilS-PilR two-component system (TCS) regulates expression of the type IV pilus (T4P) major subunit PilA, while biosynthesis of the single polar flagellum is regulated by a hierarchical system that includes the FleSR TCS. Previous studies in Geobacter sulfurreducens and Dichelobacter nodosus implicated PilR in regulation of non-T4P-related genes, including some involved in flagellar biosynthesis. Here we used RNAseq analysis to identify genes in addition to pilA with changes in expression in the absence of pilR . Among these were 10 genes inversely dysregulated by loss of pilA versus pilR , even though both pilA and pilR mutants lack T4P and pilus-related phenotypes. The products of those genes - many of which were hypothetical - may be important for virulence and surface-associated behaviours, as mutants had altered swarming motility, biofilm formation, type VI secretion, and pathogenicity in a nematode model. Further, the PilSR TCS positively regulated transcription of fleSR , and thus many genes in the FleSR regulon. As a result, pilSR deletion mutants had defects in swimming motility that were independent of the loss of PilA. Together these data suggest that in addition to controlling T4P expression, PilSR have a broader role in the regulation of P. aeruginosa motility and surface sensing behaviours.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».