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Enregistrement W2804807819 · doi:10.1016/j.preghy.2018.05.007

Creating biobanks in low and middle-income countries to improve knowledge – The PREPARE initiative

2018· article· en· W2804807819 sur OpenAlexaff
Leandro G. Oliveira, Marcos Augusto Bastos Dias, Arundhanthi Jeyabalan, Beth A. Payne, Christopher W.G. Redman, Laura A. Magee, Lucilla Poston, Lucy C. Chappell, Paul T. Seed, James M. Roberts

Notice bibliographique

RevuePregnancy Hypertension · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEthics in Clinical Research
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoMinistério da Ciência, Tecnologia e InovaçãoNational Institute for Health and Care ResearchBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésBiobankLow and middle income countriesBusinessKnowledge managementEconomic growthDeveloping countryComputer scienceBioinformaticsEconomics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Millennium Development Goal 5, a project signed in 2000, intended to improve maternal health and reduce maternal mortality by 75% by 2015. Despite all efforts, little progress has been achieved in low and middle-income countries (LMIC) and 99% of all maternal deaths related to pre-eclampsia (PE) still occur in these settings. It is important to determine whether women in LMIC, where PE carries a greater risk than in high-income countries (HIC), have unique risk factors. Some variances may alter the risk, severity and pertinent pathophysiology of PE. We posit based upon this, that women from LMIC may have biomarkers specific to this population. Discovering such specific biomarkers and testing the relevance of biomarkers developed in high-income populations could increase the clinical usefulness of these analyses without increasing cost-effective approaches for prediction of PE. Here we briefly describe our platform to develop the PREPARE - Biobank in tertiary hospitals or basic units for antenatal care from 6 different cities in Brazil. The PREPARE - Biobank has been developed with two arms. The first arm is a cross-sectional study that will collect clinical information and biosamples from more than 1000 women who developed preterm PE. The second arm is a cohort study of 7000 women. It will collect clinical information and longitudinal biosamples from women at three times during pregnancy, <16 weeks, between 28 and 32 weeks and at delivery or diagnosis of adverse outcomes. The biobank will be supported and complemented by a Brazilian database using the CoLab COLLECT Database.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,062
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,075
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,062
Score d'incertitude au seuil0,329

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0620,075
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0060,006
Études des sciences et des technologies0,0030,002
Communication savante0,0100,011
Science ouverte0,0040,022
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0120,010

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,227
Tête enseignante GPT0,457
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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