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Enregistrement W2806074738 · doi:10.1200/edbk_199665

Moving From Mutation to Actionability

2018· review· en· W2806074738 sur OpenAlexaff
Ilaria Colombo, Katherine C. Kurnit, Shannon N. Westin, Amit M. Oza

Notice bibliographique

RevueAmerican Society of Clinical Oncology Educational Book · 2018
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMutationGeneticsComputer sciencePsychologyBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The diffusion of high-throughput next-generation sequencing technologies has sustained massive parallel sequencing of tumor tissue providing a deep insight into tumor biology and advancement of personalized medicine. A substantial number of targeted agents have been investigated in gynecologic cancer and some have received U.S. Food and Drug Administration approval, like PARP inhibitors in ovarian cancer, bevacizumab in ovarian and cervical cancers, and pembrolizumab in microsatellite-unstable or mismatch repair-deficient endometrial cancer. To improve effectiveness of targeted therapy, identification of predictive biomarkers able to guide the selection of the correct drug for the correct patient is crucial. Different limitations must be addressed to favor a more rapid implementation of a genotyping approach in treatment selection, such as the possibility to easily assess tumor heterogeneity and clonal evolution along the disease trajectory and the need for innovative trial designs like adaptive or basket trials incorporating molecular features as selection criteria. A deep dive into the genomic features of exceptional responders may also favor better understanding of tumor biology, mechanism of action of a specific target agent, and identification or predictive biomarkers for subsequent tailored studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,842
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,079
Tête enseignante GPT0,484
Écart entre enseignants0,406 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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