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Enregistrement W2807183065 · doi:10.1016/j.mrgentox.2018.05.021

Identifying germ cell mutagens using OECD test guideline 488 (transgenic rodent somatic and germ cell gene mutation assays) and integration with somatic cell testing

2018· article· en· W2807183065 sur OpenAlexafffund
Francesco Marchetti, Marilyn J. Aardema, Carol Beevers, Jan van Benthem, Roger Godschalk, Andrew Williams, Carole L. Yauk, Robert R. Young, George R. Douglas

Notice bibliographique

RevueMutation Research/Genetic Toxicology and Environmental Mutagenesis · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCarcinogens and Genotoxicity Assessment
Établissements canadiensHealth Canada
Organismes subventionnairesHealth CanadaHealth and Environmental Sciences Institute
Mots-clésSomatic cellGerm cellBiologySpermGermGermlineTransgeneCellAndrologyAzoospermiaGeneticsCell biologyGeneMedicineInfertility

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Organisation for Economic Co-operation and Development Test Guideline 488 (TG 488) provides recommendations for assessing germ cell and somatic cell mutagenicity using transgenic rodent (TGR) models. However, important data gaps exist for selecting an optimal approach for simultaneously evaluating mutagenicity in both cell types. It is uncertain whether analysis of germ cells from seminiferous tubules (hereafter, tubule germ cells) or caudal sperm within the recommended design for somatic tissues (i.e., 28 days of exposure plus three days of fixation time, 28 + 3d) has enough sensitivity to detect an effect as compared with the analysis of sperm within the recommended design for germ cells (i.e., 28 + 49d and 28 + 70d for mouse and rat, respectively). To address these data gaps, the Germ Cell workgroup of the Genetic Toxicology Technical Committee of the Health and Environmental Sciences Institute reviewed the available TGR mutagenicity data in male germ cells, and, characterized the exposure history of tubule germ cells for different sampling times to evaluate its impact on germ cell mutagenicity testing using TG 488. Our analyses suggest that evaluating mutant frequencies in: i) sperm from the cauda epididymis at 28 + 3d does not provide meaningful mutagenicity data; ii), tubule germ cells at 28 + 3d provides reliable mutagenicity data only if the results are positive; and iii) tubule germ cells at 28 + 28d produces reliable positive and negative results in both mice and rats. Thus, the 28 + 28d regimen may provide an approach for simultaneously assessing mutagenicity in somatic tissues and germ cells from the same animals. Further work is required to support the 28 + 28d protocol for tissues other than slowly proliferating tissues as per current TG 488. Finally, recommendations are provided to guide the experimental design for germ cell mutagenicity data for regulatory submission, as well as other possible approaches to increase the reliability of the TGR assay.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,106
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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