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Enregistrement W2808207128 · doi:10.1172/jci97116

Inherited p40phox deficiency differs from classic chronic granulomatous disease

2018· article· en· W2808207128 sur OpenAlexafffund
Annemarie van de Geer, Alejandro Nieto-Patlán, Douglas B. Kuhns, Anton T. J. Tool, Andrés A. Arias, Matthieu Bouaziz, Martin de Boer, José Luis Franco, Roel P. Gazendam, John L. van Hamme, Michel van Houdt, Karin van Leeuwen, Paul Verkuijlen, Timo K. van den Berg, Juan F. Álzate, Carlos A. Arango-Franco, Vritika Batura, Andrea Bernasconi, Barbara Boardman, Claire Booth, Siobhan O. Burns, Felipe Cabarcas, Nadine Cerf–Bensussan, Fabienne Charbit‐Henrion, Anniek Corveleyn, Caroline Deswarte, María Esnaola Azcoiti, Dirk Foell, John I. Gallin, Carlos Garcés, Margarida Guedes, Claas Hinze, Steven M. Holland, Stephen Hughes, Patricio Ibáñez, Harry L. Malech, Isabelle Meyts, Marcela Moncada‐Vélez, Kunihiko Moriya, Esmeralda Neves, Matías Oleastro, Laura Pérez, Vimel Rattina, Carmen Oleaga‐Quintas, Neil Warner, Aleixo M. Muise, Jeanet Serafín‐López, Eunice Trindade, Julia Vasconcelos, Séverine Vermeire, Helmut Wittkowski, Austen Worth, Laurent Abel, Mary C. Dinauer, Peter D. Arkwright, Dirk Roos, Jean‐Laurent Casanova, Taco W. Kuijpers, Jacinta Bustamante

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Investigation · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueNeutrophil, Myeloperoxidase and Oxidative Mechanisms
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNHLBI Division of Intramural ResearchNational Center for Research ResourcesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health ResearchNational Center for Advancing Translational SciencesConsejo Nacional de Ciencia y TecnologíaAgence Nationale de la RechercheNational Institutes of HealthU.S. Department of Health and Human ServicesJapan Foundation for Pediatric ResearchLastentautien TutkimussäätiöInstitut des maladies génétiques ImagineLeona M. and Harry B. Helmsley Charitable TrustInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleDivision of Intramural Research, National Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesUniversité Paris DescartesSt. Giles FoundationDepartamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación (COLCIENCIAS)
Mots-clésChronic granulomatous diseaseNADPH oxidaseCompound heterozygosityBiologyOxidase testAspergillus fumigatusPhagocyteImmunologyMutationCandida albicansMicrobiologyGenePhagocytosisGeneticsEnzymeReactive oxygen speciesBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Biallelic loss-of-function (LOF) mutations of the NCF4 gene, encoding the p40phox subunit of the phagocyte NADPH oxidase, have been described in only 1 patient. We report on 24 p40phox-deficient patients from 12 additional families in 8 countries. These patients display 8 different in-frame or out-of-frame mutations of NCF4 that are homozygous in 11 of the families and compound heterozygous in another. When overexpressed in NB4 neutrophil-like cells and EBV-transformed B cells in vitro, the mutant alleles were found to be LOF, with the exception of the p.R58C and c.120_134del alleles, which were hypomorphic. Particle-induced NADPH oxidase activity was severely impaired in the patients' neutrophils, whereas PMA-induced dihydrorhodamine-1,2,3 (DHR) oxidation, which is widely used as a diagnostic test for chronic granulomatous disease (CGD), was normal or mildly impaired in the patients. Moreover, the NADPH oxidase activity of EBV-transformed B cells was also severely impaired, whereas that of mononuclear phagocytes was normal. Finally, the killing of Candida albicans and Aspergillus fumigatus hyphae by neutrophils was conserved in these patients, unlike in patients with CGD. The patients suffer from hyperinflammation and peripheral infections, but they do not have any of the invasive bacterial or fungal infections seen in CGD. Inherited p40phox deficiency underlies a distinctive condition, resembling a mild, atypical form of CGD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,683
Score d'incertitude au seuil0,580

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations133
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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