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Enregistrement W2808721921 · doi:10.1093/neuonc/noy059.037

ATRT-40. IMPACT OF MOLECULAR SUBTYPES ON TREATMENT OUTCOMES IN RHABDOID TUMORS - A REPORT FROM THE RARE TUMOR CONSORTIUM

2018· article· en· W2808721921 sur OpenAlexaff
Ben Ho, Adriana Fonseca, Salma Al‐Karmi, Ashley Margol, Fupan Yao, Sylvia Cheng, Ronald Grant, Jordan Handsford, Abha A. Gupta, Alexandre Vasiljevic, Bruce Pawel, Nada Jabado, Cynthia Hawkins, Lucie Lafay‐Cousin, Alexander R. Judkins, Éric Bouffet, Annie Huang

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChromatin Remodeling and Cancer
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalMcGill UniversityBC Children's HospitalHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAtypical teratoid rhabdoid tumorOncologyInternal medicineMedicineCancer researchImmunohistochemistryBioinformaticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rhabdoid Tumors (RTs) are rare heritable cancers with bi-allelic SMARCB1/A4 alterations, arising in the brain (Atypical Teratoid/Rhabdoid Tumors/ATRTs) and in various extra-cranial locations (Malignant Rhabdoid Tumors/MRTs). Recent studies uncovered molecular sub-types of ATRTs and MRTs, however, the molecular relationship and clinico-pathologic implications of MRTs and ATRTs sub-types remain unclear. To inform clinical understanding of ATRTs and MRTs, 450/850K methylation array profiles generated from 202 ATRTs and 57 MRTs were used to define molecular categories of ATRTs/MRTs and examine their clinical significance. ATRTs segregated into 3 known molecular subgroups, group 1/SHH (n=87), group 2A/TYR (n=69), group 2B/MYC (n= 46); 13 and 44 MRTs respectively segregated with group 2A/TYR and 2B/MYC ATRTs. Median patient age was 19.1 months for group 1/SHH, 12.3 months for group 2A/TYR and 22.3 months for group 2B/MYC Rhabdoid tumors. Complete clinical information and treatment information available for 162 patients (n=125 ATRTs and n=37 MRTs), indicated only 65 patients received a combined chemo-radiation therapy. 24-month PFS was 30%,38% and 28% and the 24-month OS was 43%,48% and 43% for subgroups 1/SHH, 2A/TYR and 2B/MYC tumors respectively. MRT and ATRT comprise a biological spectrum with overlapping molecular features. Clinicopathologic analysis suggest ATRT/MRT molecular subtypes have different therapeutic response to chemo-radiotherapeutic regimens.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,032
Score d'incertitude au seuil0,577

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
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