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Enregistrement W2808759948 · doi:10.1016/j.bbmt.2018.06.010

Outcomes of Measurable Residual Disease in Pediatric Acute Myeloid Leukemia before and after Hematopoietic Stem Cell Transplant: Validation of Difference from Normal Flow Cytometry with Chimerism Studies and Wilms Tumor 1 Gene Expression

2018· article· en· W2808759948 sur OpenAlexaff
David A. Jacobsohn, Michael R. Loken, Mingwei Fei, Alexia Adams, Lisa Eidenschink Brodersen, Brent R. Logan, Kwang Woo Ahn, Bronwen E. Shaw, Morris Kletzel, Marie Olszewski, Sana Khan, Soheil Meshinchi, Amy K. Keating, Andrew C. Harris, Pierre Teira, Reggie Duerst, Steven Margossian, Paul L. Martin, Aleksandra Petrović, Christopher C. Dvorak, Eneida R. Nemecek, Michael W. Boyer, Allen Chen, Jeffrey Davis, Shalini Shenoy, Süreyya Savaşan, Michelle Hudspeth, Roberta H. Adams, Victor Lewis, Albert Kheradpour, Kimberly A. Kasow, Alfred P. Gillio, Ann E. Haight, Monica Bhatia, Barbara Bambach, Hilary Haines, Troy C. Quigg, Robert Greiner, Julie‐An Talano, David Delgado, Alexandra Cheerva, Madhu Gowda, Sanjay Ahuja, M. Fevzi Özkaynak, David Mitchell, Kirk R. Schultz, Terry J. Fry, David M. Loeb, Michael A. Pulsipher

Notice bibliographique

RevueBiology of Blood and Marrow Transplantation · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensMcGill University Health CentreMontreal Children's HospitalBC Children's HospitalUniversity of CalgaryUniversité de MontréalAlberta Children's HospitalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Heart, Lung, and Blood Institute
Mots-clésMedicineMinimal residual diseaseHematopoietic stem cell transplantationFlow cytometryWilms' tumorMyeloid leukemiaInternal medicineTransplantationOncologyProspective cohort studyDiseaseMyeloidLeukemiaPathologyGastroenterologyImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We enrolled 150 patients in a prospective multicenter study of children with acute myeloid leukemia undergoing hematopoietic stem cell transplantation (HSCT) to compare the detection of measurable residual disease (MRD) by a "difference from normal" flow cytometry (ΔN) approach with assessment of Wilms tumor 1 (WT1) gene expression without access to the diagnostic specimen. Prospective analysis of the specimens using this approach showed that 23% of patients screened for HSCT had detectable residual disease by ΔN (.04% to 53%). Of those patients who proceeded to transplant as being in morphologic remission, 10 had detectable disease (.04% to 14%) by ΔN. The disease-free survival of this group was 10% (0 to 35%) compared with 55% (46% to 64%, P < .001) for those without disease. The ΔN assay was validated using the post-HSCT specimen by sorting abnormal or suspicious cells to confirm recipient or donor origin by chimerism studies. All 15 patients who had confirmation of tumor detection relapsed, whereas the 2 patients with suspicious phenotype cells lacking this confirmation did not. The phenotype of the relapse specimen was then used retrospectively to assess the pre-HSCT specimen, allowing identification of additional samples with low levels of MRD involvement that were previously undetected. Quantitative assessment of WT1 gene expression was not predictive of relapse or other outcomes in either pre- or post-transplant specimens. MRD detected by ΔN was highly specific, but did not identify most relapsing patients. The application of the assay was limited by poor quality among one-third of the specimens and lack of a diagnostic phenotype for comparison.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,085
Score d'incertitude au seuil0,522

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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