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Enregistrement W2808767859 · doi:10.1093/neuonc/noy059.175

EAPH-06. HYPERMUTANT PEDIATRIC HIGH GRADE GLIOMAS ARE DRIVEN BY RAS/MAPK MUTATIONS AND RESPOND TO MEK INHIBITION

2018· article· en· W2808767859 sur OpenAlexaff
Brittany Campbell, Daniel A. Morgenstern, Tatiana Lipman, David Fabrizio, Adam Shlien, Éric Bouffet, Cynthia Hawkins, Uri Tabori

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTrametinibSelumetinibMAPK/ERK pathwayMedicineCancer researchMEK inhibitorMutationBiologySignal transductionGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hypermutant pediatric high grade gliomas (pHGG) constitute 5–10% of PHGG and are almost invariantly caused by replication repair deficiency (RRD). Constitutive activation of the RAS/MAPK pathway via oncogenic mutations can be targeted with MEK inhibitors (MEKi). We hypothesized that hypermutant RRD PHGG would harbor mutations in NF1 and other MAPK pathway regulators, making their tumors susceptible to MEKi. Tumor sequencing data from >1200 pediatric tumors was extracted from our foundation-medicine cohort. Exome and RNA-seq was performed on tumors from our international RRD consortium. Xenografts from patient derived pHGG were established in NOD-SCID mice and treated with Trametinib and Selumetinib. Functional experiments were performed to demonstrate deregulation of the MAPK pathway in the tumors. Screening of 1215 cancers revealed that RAS/MAPK mutations are the second most common mutation in pediatric tumors. Exome data from patients revealed 95% of PHGG were found to harbor mutations in key RAS/MAPK pathway regulators. Subclonal analysis reveals mutations in the pathway in each subclone and enrichment of these mutations over time. In-vitro and in-vivo treatment of patient derived RRD hypermutant PHGG with MEKi revealed significant tumor suppression with a 50% decrease in tumor volume and improved survival (p <0.001). Finally, two patients with progressive/recurrent PHGG treated with Selumetinib and trametinib exhibited >90% objective tumor response and prolonged survival. These preclinical and clinical observations suggest a novel therapeutic option for children with hypermutant RRD PHGG based on possible oncogenic addiction to RAS/MAPK alterations. These observations are the basis of the upcoming SU2C international clinical trial.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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