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Enregistrement W2809103371 · doi:10.1093/neuonc/noy059.012

ATRT-13. CANCER PREDISPOSITION AMONG CHILDREN WITH RHABDOID TUMORS: A SINGLE-CENTRE RETROSPECTIVE REVIEW

2018· article· en· W2809103371 sur OpenAlexaff
Hallie Coltin, Anna Pan, David Malkin, Annie Huang, Catherine Goudie

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChromatin Remodeling and Cancer
Établissements canadiensUniversity of TorontoChildren's Hospital of Eastern OntarioHospital for Sick ChildrenUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSMARCB1GermlineGenetic testingMedicineAtypical teratoid rhabdoid tumorFamily historyReferralGermline mutationRetrospective cohort studyGenetic predispositionCancerMedical geneticsPediatricsOncologyMutationInternal medicineGeneticsBiologyFamily medicineGeneImmunohistochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rhabdoid tumor predisposition syndrome (RTPS) from SMARCB1 germline mutations must be ruled out in children with rhabdoid tumors (RT). The aim was to describe the diagnostic details of children with RT, genetic referral practices, and rates of SMARCB1 germline pathogenic mutations, and to compare clinical features of children with and without RTPS. The medical charts of sequential children diagnosed with RT at the Hospital for Sick Children from 1995–2016 were reviewed for the diagnostic details, family histories, and genetic testing results. Fifty-nine children diagnosed with RT at a mean age of 37.6 months were included. Atypical teratoid rhabdoid tumors represented 73% of the tumors. Of the patients with family histories documented, 17% were suspicious for cancer predisposition. Of the 31 patients with genetic testing results, 12 had SMARCB1 pathogenic mutations. The mean age of diagnosis was 12.0 months for children with RTPS compared to 37.6 months in those without RTPS. In children presenting at ≤ 12 months of age, 64% were subsequently diagnosed with germline SMARCB1 mutations. When the age limit was increased to ≤ 36 months, the rate of SMARCB1 mutations was 42%, while this rate was 25% in those aged > 36 months. Rates of SMARCB1 germline mutations increase with younger age, but the elevated rates of RTPS detection in this cohort for all ages support the practice that all children diagnosed with RT should undergo genetic testing to investigate for RTPS, even if the family history is not suggestive of inherited cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0040,007
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
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Résumé présentoui

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