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Enregistrement W2809112401 · doi:10.1161/atvb.37.suppl_1.348

Abstract 348: Lys 42, 43, 44 and Arg 12 of Thrombin Activable Fibrinolysis Inhibitor Comprise Thrombomodulin Binding Exosite Essential for Exerting Its Antifibrinolytic Activity

2017· article· en· W2809112401 sur OpenAlexaff
Paul Y. Kim, Chengliang Wu, Alan R. Stafford, James C. Fredenburgh, Jeffrey I. Weitz, Ann Gils, Paul Declerck

Notice bibliographique

RevueArteriosclerosis Thrombosis and Vascular Biology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésThrombomodulinThrombinPlasminChemistryAntifibrinolyticFibrinolysisBiochemistryMolecular biologyPlasminogen activatorEnzymeBiologyInternal medicineEndocrinologyImmunologyMedicinePlatelet

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The thrombin-thrombomodulin (TM) complex activates thrombin-activable fibrinolysis inhibitor (TAFI) more efficiently than thrombin or plasmin alone. The exosite on TAFI required for its TM-dependent activation by thrombin has not been identified. Based on previous work by us and others, we generated TAFI variants with one or more of residues Lys 42, Lys 43, Lys 44 and Arg 12 within the activation peptide mutated to alanine. Mutation of one, two, or three Lys residues or the Arg residue alone decreased the catalytic efficiency of TAFI activation by thrombin-TM by 2.4-, 3.2-, 4.7-, and 15.0-fold, respectively, and increased the TAFI concentrations required for half-maximal prolongation of clot lysis times (K 1/2 ) by 3-, 4,- 15-, and 24-fold, respectively. Mutation of all four residues eliminated TM binding, decreased the catalytic efficiency of TAFI activation by 45.0-fold, increased the K 1/2 by 130-fold, and abolished antifibrinolytic activity in a clot lysis assay. When thrombin or plasmin was used as the activator, mutation of all four residues reduced the rate of activation by 1.1- and 4.0-fold compared with wild-type TAFI, respectively, suggesting that the mutation only impacted activation kinetics by thrombin-TM. Surface plasmon resonance data show that mutation of the four residues results in complete loss of binding, either in the presence or absence of thrombin. Together, our findings suggest that these four residues are critical for the interaction of TAFI with the thrombin-TM complex that modulates its antifibrinolytic activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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