Abstract 348: Lys 42, 43, 44 and Arg 12 of Thrombin Activable Fibrinolysis Inhibitor Comprise Thrombomodulin Binding Exosite Essential for Exerting Its Antifibrinolytic Activity
Notice bibliographique
Résumé
The thrombin-thrombomodulin (TM) complex activates thrombin-activable fibrinolysis inhibitor (TAFI) more efficiently than thrombin or plasmin alone. The exosite on TAFI required for its TM-dependent activation by thrombin has not been identified. Based on previous work by us and others, we generated TAFI variants with one or more of residues Lys 42, Lys 43, Lys 44 and Arg 12 within the activation peptide mutated to alanine. Mutation of one, two, or three Lys residues or the Arg residue alone decreased the catalytic efficiency of TAFI activation by thrombin-TM by 2.4-, 3.2-, 4.7-, and 15.0-fold, respectively, and increased the TAFI concentrations required for half-maximal prolongation of clot lysis times (K 1/2 ) by 3-, 4,- 15-, and 24-fold, respectively. Mutation of all four residues eliminated TM binding, decreased the catalytic efficiency of TAFI activation by 45.0-fold, increased the K 1/2 by 130-fold, and abolished antifibrinolytic activity in a clot lysis assay. When thrombin or plasmin was used as the activator, mutation of all four residues reduced the rate of activation by 1.1- and 4.0-fold compared with wild-type TAFI, respectively, suggesting that the mutation only impacted activation kinetics by thrombin-TM. Surface plasmon resonance data show that mutation of the four residues results in complete loss of binding, either in the presence or absence of thrombin. Together, our findings suggest that these four residues are critical for the interaction of TAFI with the thrombin-TM complex that modulates its antifibrinolytic activity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».