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Enregistrement W2809198755 · doi:10.1093/neuonc/noy059.481

MBRS-36. IDENTIFICATION OF TWO PROTEIN-SIGNALING STATES DELINEATING TRANSCRIPTIONALLY HETEROGENEOUS HUMAN MEDULLOBLASTOMA

2018· article· en· W2809198755 sur OpenAlexaff
Walderik W. Zomerman, Sabine Plasschaert, Siobhan Conroy, Frank J.G. Scherpen, Tiny Meeuwsen-de Boer, Harm-Jan Lourens, Sergi Guerrero Llobet, Marlinde J. Smit, Lorian Slagter‐Menkema, Annika Seitz, Corrie Gidding, Esther Hulleman, Pieter Wesseling, Lisethe Meijer, Léon C.L.T. van Kempen, Anke van den Berg, Daniël O. Warmerdam, Frank A.E. Kruyt, Floris Foijer, Marcel A.T.M. van Vugt, Wilfred F.A. den Dunnen, Eelco W. Hoving, Victor Guryev, Eveline de Bont, Sophia W.M. Bruggeman

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHedgehog Signaling Pathway Studies
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedulloblastomaBiologySignal transductionPhosphoproteinPhosphorylationCancer researchCell cycleApoptosisDNA damageCell biologyDNAGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Medulloblastoma consists of different transcriptional subgroups. To characterize medulloblastoma at the phosphoprotein-signaling level, we performed high-throughput peptide phosphorylation profiling on a cohort of SHH, Group 3 and Group 4 medulloblastomas. We identified two major protein-signaling profiles. One profile was associated with rapid death post-recurrence and resembled MYC-like signaling for which MYC lesions are sufficient but not necessary. The second profile showed DNA damage, apoptotic and neuronal signaling. Integrative analysis demonstrated that heterogeneous transcriptional input converges on these protein-signaling profiles: all SHH and a subset of Group 3 patients exhibited the MYC-like protein-signaling profile, the other Group 3 subset and Group 4 patients displayed the DNA damage/apoptotic/neuronal signaling profile. Functional analysis highlighted cell cycle progression and protein synthesis as therapeutic targets for MYC-like medulloblastoma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,934

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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