Reporters to mark and eliminate basal or luminal epithelial cells in culture and in vivo
Notice bibliographique
Résumé
The contribution of basal and luminal cells to cancer progression and metastasis is poorly understood.We report generation of reporter systems driven by either keratin-14 (K14) or keratin-8 (K8) promoter that not only express a fluorescent protein but also an inducible suicide gene.Transgenic mice express the reporter genes in the right cell compartments of mammary gland epithelia and respond to treatment with toxins.In addition, we engineered the reporters into 4T1 metastatic mouse tumor cell line and demonstrate that K14+ cells, but not K14-or K8+, are both highly invasive in three-dimensional (3D) culture and metastatic in vivo.Treatment of cells in culture, or tumors in mice, with reporter-targeting toxin inhibited both invasive behavior and metastasis in vivo.RNA sequencing (RNA-seq), secretome, and epigenome analysis of K14+ and K14-cells led to the identification of amphoterin-induced protein 2 (Amigo2) as a new cell invasion driver whose expression correlated with decreased relapse-free survival in patients with TP53 wild-type (WT) breast cancer. Author summaryMost, if not all, cancer-related deaths result from metastasis.The differentiation states of the cancer epithelial cells are thought to be a critical determinant of metastasis.Epithelial cancer cells with a basal cell type are more aggressive in forming metastasis than cancer cells with luminal cell type.Very little is known about how the differentiation states impact metastasis or the molecular mechanisms involved.In this study, we develop and characterize new reporters that fluorescently mark cells in luminal or basal status.These reporters are also coupled to "suicide genes," which can be used to inducibly and selectively eliminate cells expressing the reporters.We find that elimination of the basal cell
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».