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Enregistrement W2809494470 · doi:10.1093/neuonc/noy059.715

TBIO-27. GABRIELLA MILLER KIDS FIRST DATA RESOURCE CENTER ADVANCING GENETIC RESEARCH IN CHILDHOOD CANCER AND STRUCTURAL BIRTH DEFECTS THROUGH LARGE SCALE INTEGRATED DATA-DRIVEN DISCOVERY AND CLOUD-BASED PLATFORMS FOR COLLABORATIVE ANALYSIS

2018· article· en· W2809494470 sur OpenAlexaff
Allison P. Heath, Pichai Raman, Yuankun Zhu, Jena Lilly, Deanne Taylor, Phillip B. Storm, Angela J. Waanders, Sam Volchenboum, Lincoln Stein, Kyle Ellrott, Brandi N. Davis‐Dusenbery, Robert L. Grossman, Vincent Ferretti, Sabine Mueller, Javad Nazarian, Adam Resnick

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueHealth, Environment, Cognitive Aging
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésContext (archaeology)Psychological interventionResource (disambiguation)MedicineEarly childhoodTranslational researchData sciencePsychologyBiologyComputer sciencePathologyDevelopmental psychologyPsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Childhood cancers and structural birth share a common context of context in developmental biology that remains poorly defined. Indeed, epidemiologically, pediatric central nervous system tumors are some of the most frequently co-occurring cancers in children with birth defects. While researchers have been increasingly identifying the underlying biological causes of these conditions, the role of genetics and/or shared pathways across cancer and birth defects is not yet fully understood. A better understanding of a common developmental setting could spur advancements in prevention, early detection, and therapeutic interventions that will improve the lives of the children and families impacted by these conditions. The Common Fund’s Gabriella Miller Kids First Pediatric Research Program represents a national initiative focused on developing a large-scale genomic data supported by a data resource center (DRC) that will empower collaborative discovery and shared resources for research. The DRC will allow researchers everywhere access to vast amounts of childhood cancer and structural birth defects through cloud-based computational and analytics portals including CAVATICA (cavatica.org). Approximately 8,000 patient samples will be ready for analysis at the launch this year including a data cohort of more than 2000 pediatric brain tumor WGS/RNAseq provided by the Children’s Brain Tumor Tissue Consortium (CBTTC) and the Pacific Pediatric Neuro-Oncology Consortium (PNOC). More than 25,000 WGS are expected to be processed by 2019, making the Kids First Data Resource Center the largest pediatric data cohort of its kind.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,398
Score d'incertitude au seuil0,986

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,352
Écart entre enseignants0,307 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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