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Enregistrement W2809523598 · doi:10.1111/age.12660

Two <i><scp>MC</scp>1R</i> loss‐of‐function alleles in cream‐coloured Australian Cattle Dogs and white Huskies

2018· article· en· W2809523598 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueAnimal Genetics · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématiquemelanin and skin pigmentation
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesUniversity of BernSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungNational Science Foundation
Mots-clésAlleleBiologyGeneticsCoatLocus (genetics)GenotypeBreedSingle-nucleotide polymorphismCoding regionCompound heterozygosityPhenotypeGeneMolecular biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Loss‐of‐function variants in the MC 1R gene cause recessive red or yellow coat‐colour phenotypes in many species. The canine MC 1R :c.916C&gt;T (p.Arg306Ter) variant is widespread and found in a homozygous state in many uniformly yellow‐ or red‐coloured dogs. We investigated cream‐coloured Australian Cattle Dogs whose coat colour could not be explained by this variant. A genome‐wide association study with 10 cream and 123 red Australian Cattle Dogs confirmed that the cream locus indeed maps to MC 1R . Whole‐genome sequencing of cream dogs revealed a single nucleotide variant within the MITF binding site of the canine MC 1R promoter. We propose to designate the mutant alleles at MC 1R :c.916C&gt;T as e 1 and at the new promoter variant as e 2 . Both alleles segregate in the Australian Cattle Dog breed. When we considered both alleles in combination, we observed perfect association between the MC 1R genotypes and the cream coat colour phenotype in a cohort of 10 cases and 324 control dogs. Analysis of the MC 1R transcript levels in an e 1 /e 2 compound heterozygous dog confirmed that the transcript levels of the e 2 allele were markedly reduced with respect to the e 1 allele. We further report another MC 1R loss‐of‐function allele in Alaskan and Siberian Huskies caused by a 2‐bp deletion in the coding sequence, MC 1R :c.816_817del CT . We propose to term this allele e 3 . Huskies that carry two copies of MC 1R loss‐of‐function alleles have a white coat colour.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,202
Score d'incertitude au seuil0,595

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle