Genetic Analysis of Floral Symmetry Transition in African Violet Suggests the Involvement of Trans-acting Factor for CYCLOIDEA Expression Shifts
Notice bibliographique
Résumé
With growing demand for ornamental use, African violet (Saintpaulia ionantha) has been popular for variations in colors, shapes and their rapid responses to artificial selection. Wild type African violet (WT) is characterized by flowers with bilateral symmetry yet reversals to showy radially symmetrical flowers such as dorsalized (DA) and ventralized actinomorphic (VA) peloria are common. Genetic crosses among WT, DA and VA revealed that these floral symmetry transitions are likely to be controlled by three alleles at single locus in which the levels of dominance are in a hierarchical fashion. To investigate whether floral symmetry gene was responsible for these reversals, orthologues of CYCLOIDEA (CYC) were isolated and correlated their expressions to floral symmetry transitions. Quantitative RT-PCR and in-situ results indicated dorsal specific CYCs expression in WT S. ionantha (SiCYC1A and SiCYC1B) were shifted in DA with extended expression heterotopically to all petals, but in VA, SiCYC1s’ dorsally specific expressions were greatly reduced. Selection signature analysis revealed that the major high-expressed copy of SiCYC1A had been constrained under purifying selection, while the low expressed helper SiCYC1B, appeared to be relaxed from purifying selection after the duplication into SiCYC1A and SiCYC1B. Heterologous expression of SiCYC1A in Arabidopsis showed petal growth retardation which was attributed to limited cell proliferation. While expression shifts of SiCYC1A and SiCYC1B correlate perfectly to the resulting symmetry phenotype transitions in F1s of WT and DA, there is no certain allelic combination of inherited SiCYC1s associated with specific symmetry phenotypes. This indicates that although the expression shifts of SiCYC1A/1B are responsible for the two contrasting actinomorphic reversals in African violet, they are likely controlled by upstream trans-acting factors or epigenetic regulations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».