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Enregistrement W2809952540 · doi:10.3389/fpls.2018.01008

Genetic Analysis of Floral Symmetry Transition in African Violet Suggests the Involvement of Trans-acting Factor for CYCLOIDEA Expression Shifts

2018· article· en· W2809952540 sur OpenAlexfundno aff
Hui-Ju Hsu, Chengwen He, Wen‐Hsi Kuo, Kuan‐Ting Hsin, Jing‐Yi Lu, Zhao‐Jun Pan, Chun‐Neng Wang

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Plant Science · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Reproductive Biology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Taiwan UniversityUniversity of British ColumbiaMinistry of Science and Technology, TaiwanNational Science Council
Mots-clésPetalBiologyPhenotypeAlleleLocus (genetics)Directional selectionGeneTransition (genetics)Dominance (genetics)GynoeciumSymmetry in biologyEvolutionary biologyGeneticsBotanyGenetic variationStamen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

With growing demand for ornamental use, African violet (Saintpaulia ionantha) has been popular for variations in colors, shapes and their rapid responses to artificial selection. Wild type African violet (WT) is characterized by flowers with bilateral symmetry yet reversals to showy radially symmetrical flowers such as dorsalized (DA) and ventralized actinomorphic (VA) peloria are common. Genetic crosses among WT, DA and VA revealed that these floral symmetry transitions are likely to be controlled by three alleles at single locus in which the levels of dominance are in a hierarchical fashion. To investigate whether floral symmetry gene was responsible for these reversals, orthologues of CYCLOIDEA (CYC) were isolated and correlated their expressions to floral symmetry transitions. Quantitative RT-PCR and in-situ results indicated dorsal specific CYCs expression in WT S. ionantha (SiCYC1A and SiCYC1B) were shifted in DA with extended expression heterotopically to all petals, but in VA, SiCYC1s’ dorsally specific expressions were greatly reduced. Selection signature analysis revealed that the major high-expressed copy of SiCYC1A had been constrained under purifying selection, while the low expressed helper SiCYC1B, appeared to be relaxed from purifying selection after the duplication into SiCYC1A and SiCYC1B. Heterologous expression of SiCYC1A in Arabidopsis showed petal growth retardation which was attributed to limited cell proliferation. While expression shifts of SiCYC1A and SiCYC1B correlate perfectly to the resulting symmetry phenotype transitions in F1s of WT and DA, there is no certain allelic combination of inherited SiCYC1s associated with specific symmetry phenotypes. This indicates that although the expression shifts of SiCYC1A/1B are responsible for the two contrasting actinomorphic reversals in African violet, they are likely controlled by upstream trans-acting factors or epigenetic regulations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,218
Score d'incertitude au seuil0,305

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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