Direct Detection of <i>penA</i> Gene Associated with Ceftriaxone-Resistant <i>Neisseria gonorrhoeae</i> FC428 Strain by Using PCR
Notice bibliographique
Résumé
The ceftriaxone-resistant Neisseria gonorrhoeae FC428 clone was first observed in Japan in 2015, and in 2017, it was documented in Denmark, Canada, and Australia.Here, we describe a PCR for direct detection of the penA gene associated with this strain that can be used to enhance surveillance activities.C eftriaxone, either monotherapy or in dual therapy with azithromycin, is the mainstay of treatment of patients diagnosed with Neisseria gonorrhoeae infection in most settings (1).Therefore, the identification of any strains exhibiting resistance to ceftriaxone is of considerable public health concern.Until 2017, ceftriaxone-resistant strains of N. gonorrhoeae had been rare and typically sporadic, including in 2009, H041 in Japan (2); in 2010, F89 in France (3); in 2011, F89 in Spain (4); in 2013, A8806 in Australia (5); in 2014, GU140106 in Japan (6); and in 2015, FC428 and FC460 in Japan (7).However, there is now evidence of sustained international transmission of FC428, reported during 2017 in Canada (8) and Demark (9) (1 case each) and in Australia (2 cases) (10).Rapid and timely detection is pivotal to contain further spread of antimicrobial drugresistant N. gonorrhoeae.Here, we describe a real-time PCR protocol to facilitate enhanced surveillance for the FC428 clone.The study was approved by the University of Queensland Human Research Ethics Committee.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».