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Enregistrement W2810273617 · doi:10.1136/esmoopen-2018-eacr25.400

PO-372 Investigating the epigenetic changes underlying combination treatment of acute promyelocytic leukaemia with all-trans retinoic acid and arsenic trioxide

2018· article· en· W2810273617 sur OpenAlexaff
Thomas T. Huynh, Dejan Vidovic, Christopher Dean, K. Lee, Ian C.G. Weaver, Paola Marcato

Notice bibliographique

RevueESMO Open · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinoids in leukemia and cellular processes
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésArsenic trioxideAcute promyelocytic leukemiaRetinoic acidEpigeneticsArsenicCancer researchTretinoinMedicineChemistryBiochemistryOrganic chemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction Acute promyelocytic leukaemia (APL) results in the interrupted differentiation of granulocytes. Combination induction therapy using all-trans retinoic acid (ATRA) and arsenic trioxide (ATO) is the most effective treatment of APL. DNA methylation and histone modifications are epigenetic mechanisms of gene regulation aberrant in APL. While ATRA treatment of APL NB4 cells restores granulocyte differentiation and induces significant genome-wide changes in histone modifications, it does not affect the aberrant DNA methylation. Similarly, ATO has comparable effects. Therefore, we hypothesise that the increased effectiveness of ATRA and ATO when combined is due to epigenetic changes at both the histone and DNA methylation level, resulting in profound changes in gene expression. Material and methods We identified the concentration of ATRA and ATO in combination that induced enhanced differentiation and cell death of NB4 cells in comparison to single agent treatment through fluorescence activated cells sorting (FACS) of CD11b and 7-AAD labelled cells at 72 hours and 96 hours post treatment termination. Quantitative PCR (qPCR) was performed to determine the expression levels of a panel of genes after 72 hours of treatment and 96 hours post treatment termination. Results and discussions ATRA and ATO in combination induced significant differentiation and cell death of NB4 cells after 72 hours. Interestingly, only the combination-treated cells maintained differentiation when treatment was terminated for 96 hours. Additionally,combination treatment significantly increased the expression of several genes important in APL compared to single agent treatment after 72 hours as well as 96 hours post treatment termination. Chromatin immunoprecipitation (ChIP) is currently being utilised to investigate the enrichment of chromatin with acetylated and methylated histones, and qPCR was performed to assess the enrichment of several genes of interest. Finally, bisulfite pyrosequencing is being performed to characterise the specific methylation pattern of these genes of interest. Conclusion ATRA and ATO in combination synergistically induces the differentiation of APL NB4 cells. Together, the ChIP and bisulfite pyrosequencing experiments will enable us to characterise the effects of combination treatment at the epigenetic level. Ultimately, understanding the epigenetic changes induced by ATO and ATRA synergy can help improve treatment in the clinic.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,507

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
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Résumé présentoui

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