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Enregistrement W2810804251 · doi:10.1523/eneuro.0174-18.2018

Extending the Time Domain of Neuronal Silencing with Cryptophyte Anion Channelrhodopsins

2018· article· en· W2810804251 sur OpenAlexaff
Elena G. Govorunova, Oleg A. Sineshchekov, Raheleh Hemmati, Roger Janz, Olivier Morelle, Michael Melkonian, Gane Ka‐Shu Wong, John L. Spudich

Notice bibliographique

RevueeNeuro · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiquePhotoreceptor and optogenetics research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Institute of Mental HealthNational Institutes of HealthHermann Eye FundOogfondsWelch Foundation
Mots-clésOptogeneticsChannelrhodopsinRhodopsinTransmembrane domainInhibitory postsynaptic potentialGene silencingHalorhodopsinBiophysicsPhotostimulationNeuroscienceChemistryBiologyBiochemistryReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Optogenetic inhibition of specific neuronal types in the brain enables analysis of neural circuitry and is promising for the treatment of a number of neurological disorders. Anion channelrhodopsins (ACRs) from the cryptophyte alga Guillardia theta generate larger photocurrents than other available inhibitory optogenetic tools, but more rapid channels are needed for temporally precise inhibition, such as single-spike suppression, of high-frequency firing neurons. Faster ACRs have been reported, but their potential advantages for time-resolved inhibitory optogenetics have not so far been verified in neurons. We report RapACR, nicknamed so for “rapid,” an ACR from Rhodomonas salina , that exhibits channel half-closing times below 10 ms and achieves equivalent inhibition at 50-fold lower light intensity in lentivirally transduced cultured mouse hippocampal neurons as the second-generation engineered Cl – -conducting channelrhodopsin iC++. The upper limit of the time resolution of neuronal silencing with RapACR determined by measuring the dependence of spiking recovery after photoinhibition on the light intensity was calculated to be 100 Hz, whereas that with the faster of the two G. theta ACRs was 13 Hz. Further acceleration of RapACR channel kinetics was achieved by site-directed mutagenesis of a single residue in transmembrane helix 3 (Thr111 to Cys). We also show that mutation of another ACR (Cys to Ala at the same position) with a greatly extended lifetime of the channel open state acts as a bistable photochromic tool in mammalian neurons. These molecules extend the time domain of optogenetic neuronal silencing while retaining the high light sensitivity of Guillardia ACRs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,329

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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