The transcriptome of the rat subfornical organ is altered in response to early postnatal overnutrition
Notice bibliographique
Résumé
Early postnatal overnutrition in humans is associated with long-term negative outcomes including obesity, increased risk of type-II diabetes, and cardiovascular disease. Hypothalamic neurons from rodents exposed to early postnatal overnutrition show altered expression of satiety signals and receptors, and exhibit altered responses to many satiety signals, suggesting a hypothalamic link between early overnutrition and development of these sequelae. Importantly, several hypothalamic nuclei receive information regarding circulating hormones (such as insulin, leptin and ghrelin) from the subfornical organ (SFO), a forebrain sensory circumventricular organ which lacks a blood brain barrier. Previous transcriptomic studies indicate that challenges to energy balance and hydration status stimulate changes in gene expression within the SFO, including genes encoding ion channels and receptors. In order to determine if early postnatal overnutrition also causes changes in SFO gene expression which may be associated with homeostatic dysregulation, we performed whole transcriptome sequencing on SFO tissue from rats raised in small (4 pups), or control (large, 12 pups) litters. Illumina RNA sequencing was performed on SFO tissue from rats raised from small and large litters, and read sequences were aligned to the Rat Rnor_6.0 genome. Control data were further compared to previously published microarray data set for validation. We found statistically significant (p < 0.05) changes in expression of 12 transcripts, three of which have likely roles in neuronal excitability, neurite outgrowth and differentiation, and food intake ( Manf, Slc24a4, Cracr2b ). Additionally, gene ontology analysis identified a trend among significantly altered transcripts in roles for oxidative stress response. We conclude that the SFO transcriptome is subtly altered by early postnatal overnutrition, and recommend further investigation of the effect of early postnatal overnutrition on SFO physiology and morphology.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».