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Enregistrement W2832150109 · doi:10.1101/365270

Effect of <i>PPARGC1A</i> Gly428Ser (rs8192678) polymorphism on athletic sports performance: A meta-analysis

2018· preprint· en· W2832150109 sur OpenAlexaff
Phuntila Tharabenjasin, Noel Pabalan, Hamdi Jarjanazi

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Physical Performance
Établissements canadiensMinistry of the Environment, Conservation and Parks
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésConfidence intervalMeta-analysisHomogeneousOdds ratioMedicineInternal medicineDemographyPolymorphism (computer science)AlleleGeneticsMathematicsBiologyGeneCombinatorics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Genetics plays a role in sports performance (SP) which, in this study, is measured by power and endurance activities as well as a mix between the two. However, variable results from genetic association studies warrant a meta-analysis to obtain more precise estimates of the association between PPARGC1A Gly482Ser polymorphism and SP. Methods Multi-database literature search yielded 14 articles (16 studies) for inclusion. Pooled odds ratios (ORs) and 95% confidence intervals (CI) were used in estimating associations. Summary effects were modified based on statistical power. Subgroups were SP (power, endurance and mixed) and race (Caucasians and Asians). Heterogeneity was assessed with the I 2 metric and its sources examined with outlier analysis. Results Gly allele effects significantly favoring SP (OR > 1.0, P < 0.05) form the core of our findings in: (i) the homogeneous overall effect at the post-modified, post-outlier level (OR 1.13, 95% CI 1.03-1.25, P = 0.01, I 2 = 0%); (ii) initially homogeneous power SP (ORs 1.22-1.25, 95% CI 1.05-1.44, P = 0.003-0.008, I 2 = 0%) which precluded outlier treatment; (iii) pre-outlier Caucasian outcomes (ORs 1.29-1.32, 95% CI 1.12-1.54, P = 0.0005) over that of Asians with a pooled null effect (OR 0.99, 95% CI 0.72-1.99, P = 0.53-0.92); (iv) homogeneous all > 80% (ORs 1.19-1.38, 95% CI 1.05-1.66, P = 0.0007-0.007, I 2 = 0%) on account of high statistical power (both study-specific and combined). In contrast, none of the Ser allele effects significantly favored SP and no Ser-Gly genotype outcome favored SP. The core significant outcomes were robust and comparisons subjected to publication bias test showed no evidence of it. Conclusion Lines of evidence show that the Gly allele effects favor SP. These were observed in the overall, Caucasians and statistically powered comparisons which exhibited consistent significance, stability, robustness, precision and lack of bias, all of which provide good evidence of associations between the Gly allele and SP. List of abbreviations A Asian ACE Angiotensin converting enzyme ACTN3 Alpha (α)-actinin 3 AM Analysis model ANOVA Analysis of variance df Degree of freedom ES Elevated significance C Caucasian CB Clark-Baudouin CI Confidence interval CID Confidence interval difference E Endurance EH Eliminated heterogeneity F Fixed-effects Fs Favoring SP Ds Disfavoring SP Gly Glycine GS Gain in significance Het Heterogeneity HWE Hardy-Weinberg Equilibrium I 2 Measure of variability expressed in % K Number designation of the study Li Lithuania Log OR Logarithm of OR M Mixed maf Minor allele frequency M-H Mantel-Haenszel

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,012
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,017
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,063

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0120,017
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0040,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0140,057
Bibliométrie0,0050,006
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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