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Enregistrement W2861304106 · doi:10.25000/acem.416704

Assessment of the role of EGF +61A/G and EGFR R497K polymorphism in patients with inflammatory bowel disease: A case-control study

2018· article· en· W2861304106 sur OpenAlexaboutno aff
Resul Kahraman, Elif Sinem İplik, Turan Çalhan, Abdurrahman Şahin, Bedia Çakmakoğlu

Notice bibliographique

RevueARCHIVES OF CLINICAL AND EXPERIMENTAL MEDICINE · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpidermal growth factorInflammatory bowel diseaseMedicineGenotypeUlcerative colitisDiseaseAlleleInternal medicineCrohn's diseaseEpidermal growth factor receptorGastroenterologyTumor necrosis factor alphaApoptosisCase-control studyImmunologyReceptorBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aim: Epidermal growth factor (EGF) and epidermal growth factor receptor (EGFR) play an important role in the regulation of cell growth, survival, migration, apoptosis, proliferation, and differentiation. We aimed to investigate the presence of EGF (+61A/G) and EGFR R497Kpolymorphisms in patients with inflammatory bowel disease (IBD) and their associations with clinical features of the patients.Methods: This case-control study included 91 IBD patients (45 Crohn’s disease (CD) patients and 46 ulcerative colitis (UC) patients) and 129 healthy controls (HC). EGF and EGFR were genotyped by polymerase chain reaction and restriction fragment length polymorphism techniques to elucidate their association with clinical outcomes. The disease activity for UC and CD were assessed by Truelove-Witts index (TW) and Crohn's disease activity index (CDAI), respectively. The Montreal classification was used for disease involvement and behavior.Results: EGFR497 AA genotype was significantly decreased in patients with UC compared with CD and HC. In addition, the patients with UC who had EGF +61 A allele had increased risk of moderate and severe disease (p=0.28; OR= 3.13; 95% CI=0.34-28.73). The patients with CD who had the EGF61 AG genotype were found to increased risk for the presence of penetrating disease (p=0.14; χ2=5.59; OR=5.00; 95% CI=1.26-19.83). EGF +61 A genotype carriers also had higher CDAI scores (p=0.19; OR=4.00; 95% CI=0.44-36.14). In addition, A+ carriers were also found to have higher requirement for anti-TNF treatment (p=0.11; OR=5.0; 95% CI=0.56-44.4). Conclusion: In this study, EGFR 497 AA genotype was found to decrease significantly in patients with UC compared to HC and CD patients. To enlighten the mechanism, further studies with larger sample groups are needed to clarify the role of the EGF (+61A/G) and EGFR R497K genes polymorphism, and development of the etiology and pathogenesis of IBD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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