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Enregistrement W2883811505 · doi:10.1101/372524

YB-1 IS REQUIRED FOR THE GENESIS AND METASTATIC CAPACITY OF HUMAN BREAST CANCER

2018· preprint· en· W2883811505 sur OpenAlexafffund

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British ColumbiaBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesTerry Fox Research InstituteMichael Smith Health Research BCCanadian Cancer Society Research InstituteCanadian Institutes of Health ResearchCancer Research Society
Mots-clésHuman breastGene knockdownCancerDownregulation and upregulationBreast cancerCell cultureCA15-3KRASDuctal carcinoma

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Breast cancer heterogeneity has made it challenging to elucidate shared mechanisms that underpin properties that are critical to their growth in vivo . Here, we interrogate the role of YB-1 protein in the in vivo tumorigenic activity of de novo well as cell line models of human breast cancer. Short-hairpin RNA-mediated knockdown of YB-1 in MDA-MB-231 cells blocked both their local tumour-forming and lung-colonizing activity in transplanted immunodeficient mice. YB-1 knockdown also revealed its important role at early stages of human mammary cell transformation in the generation of invasive ductal carcinoma and ductal carcinoma in situ produced in mice transplanted with freshly isolated human mammary cells transduced, respectively, with KRAS G12D , or myristoylated-AKT1. Conversely, upregulated expression of YB-1 in the poorly tumorigenic T47D cells enhanced this activity. Mechanistically, reducing YB-1 levels in MDA-MB-231 cells impaired their induction of HIF1α, and G3BP1, known YB-1 translational targets and key elements of a stress-adaptive program.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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