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Enregistrement W2884510698 · doi:10.1111/2041-210x.13065

Parameterizing the robust design in the BUGS language: Lifetime carry‐over effects of environmental conditions during growth on a long‐lived bird

2018· article· en· W2884510698 sur OpenAlexfundaboutno aff
Thomas V. Riecke, Alan G. Leach, Daniel Gibson, James S. Sedinger

Notice bibliographique

RevueMethods in Ecology and Evolution · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueAvian ecology and behavior
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesU.S. Geological SurveyU.S. Fish and Wildlife ServiceInstitute for Wetland and Waterfowl Research, Ducks Unlimited CanadaNational Science Foundation
Mots-clésMark and recaptureVital ratesEmigrationPopulationBayesian probabilityStatisticsGeographyEcologyDemographyBiologyPopulation growthMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Since the initial development of the robust design, this capture‐recapture model structure has been modified to estimate temporary emigration and expanded to include auxiliary information such as band recovery and live resight data using maximum likelihood approaches. These developments have allowed investigators to separately assess individual and group effects on true survival, site fidelity, and temporary emigration. Additionally, recent advances in the BUGS language have allowed researchers to develop increasingly complex, user‐specified models in Bayesian frameworks. The robust design has rarely been implemented in the BUGS language, and previous attempts to parameterize the robust design in BUGS exhibited strong bias in estimates of temporary emigration rates. Given the limitations of current parameterizations of the robust design in Bayesian frameworks, and our research objectives, we have developed a parameterization of the robust design in the BUGS language that produces unbiased estimates of all model parameters. We use this novel model structure to examine lifetime carry‐over effects of environmental conditions during early life on annual breeding probabilities of Pacific black brent Branta bernicla nigricans breeding on the Yukon–Kuskokwim River Delta in Western Alaska. We found that individuals that were more structurally developed as goslings bred at increased rates as adults (β = 0.14, f = 0.94), with no effect on adult survival (β = 0.01, f = 0.62). Additionally, we provide evidence for long‐term declines in apparent survival of breeding adult females at the population level (β = −0.01, f = 0.90). This novel model structure can be easily expanded (Gibson et al., in press) and has important implications for population modelling at broad scales, where we apply it to a declining population of Pacific black brent. Given long‐term declines in gosling growth on the Yukon–Kuskokwim Delta, we predict future declines in population trajectories as a result of lifetime carry‐over effects of environmental conditions during growth on adult fecundity and long‐term declines in adult survival.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,027
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,082
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,027
Score d'incertitude au seuil0,145

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0270,082
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0020,003
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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