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Enregistrement W2885222641 · doi:10.5376/gab.2018.09.0005

Genome Wide Identification and Analysis of <i>TRK</i> Gene Family in <i>Aspergillus niger</i

2018· article· en· W2885222641 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueGenomics and Applied Biology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Disease Resistance and Genetics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAspergillus nigerGeneIdentification (biology)Trk receptorBiologyGeneticsGenomeBiotechnologyBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

TRK gene is related to potassium uptake and transport, which plays an important role in regulating the life activity of living organisms. Based on Aspergillus niger genome database, using bioinformatic method predicted the members of TRK gene family, gene structure and phylogenetic relationships of Aspergillus nig er. The phylogenetic tree was constructed using MEGA 6.0.6 software with Maximum Likelihood Tree method. Using PAL2NAL software estimated da/ds. The structure of the genes was analyzed by GSDS 2.0 software. The motif was analyzed by MEME program. Four members of TRK gene family in the genome of Aspergillus niger were identified, which were AnTrk1 , AnTrk2 , AnTrk3 and AnTrk4 , respectively. Both the TRK feature domain and the conserved motif were found. The structure of different genes was different, but the structure of cluster was similar. TRK gene family members of Aspergillus niger in the genetic structure and other aspects of existed significant differences with the yeast. Genetic relationships and protein interaction network analysis have further verified this conclusion. Therefore, it can infer that TRK gene of Aspergillus niger has other regulation pathways. This conclusion could provide the basis for further research on the function and mechanism of TRK osmotic stress related protein, so as to lay a foundation for understanding the mechanism of the osmotic adjustment of Aspergillus niger .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,973
Score d'incertitude au seuil0,525

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle