Mesure de l’activité de la lécithine : cholestérol acyltransférase (LCAT), une enzyme impliquée dans la biogenèse des HDL, par chromatographie liquide - spectrométrie de masse (LC-MS)
Notice bibliographique
Résumé
La lécithine : cholestérol acyltransférase, ou LCAT, est la seule enzyme plasmatique capable d’estérifier le cholestérol des lipoprotéines circulantes, une fonction importante dans la biogenèse des lipoprotéines de haute densité HDL et le transport inverse du cholestérol. Son activité est définie comme le taux d’estérification fractionnel du cholestérol libre (CL) des HDL (FERHDL). Le FERHDL est un biomarqueur candidat du risque cardiovasculaire. La réaction d’estérification implique l’hydrolyse d’un acide gras estérifié à la phosphatidylcholine (PC) et son transfert au CL, résultant en la formation d’un ester de cholestérol (CE) et d’une lysophosphatidylcholine (LPC). L’objectif de ce travail était de faire la preuve de concept d’une nouvelle méthode de mesure de l’activité LCAT par chromatographie liquide couplée à un spectromètre de masse (LC-MS), qui permet d’identifier et quantifier simultanément tous les substrats et produits de la LCAT. Avec la méthode LC-MS, il a été possible de mesurer le FERHDL comme avec la méthode enzymatique (méthode de référence pour le cholestérol libre), mais aussi des changements au niveau de lipides spécifiques. Les LPC étaient de bons marqueurs candidat de l’activité LCAT, leur abondance étant augmentée de plus de 40% suite à l’incubation. L’activité LCAT a aussi été mesurée dans des plasmas humains enrichis de plusieurs doses de LCAT humaine recombinante et les doses de 4 et 8 μg/mL suffisaient à produire des différences significatives, comparées au plasma natif, pour 5 espèces lipidiques outre le CL: les LPC(16:0) et LPC(18:0) et les PC(14:0|18:2), PC(16:0|16:1) et PC(16:0|18:0). Enfin, l’analyse de l’activité LCAT sur des échantillons de plasma humain de la Biobanque de l’Institut de Cardiologie de Montréal (50 témoins et 50 cas ayant une maladie coronarienne athérosclérotique) a permis d’étudier la modulation des espèces lipidiques dans des échantillons plus complexes qu’un groupe de plasma. De ces lipides, la PC(34 :3) était particulièrement intéressante. Son abondance était plus diminuée par l’incubation du plasma à 37°C chez les cas que chez les témoins, ce qui en fait un candidat comme biomarqueur de l’activité de la LCAT. L’application de la LC-MS à l’étude de la LCAT permet donc une meilleure compréhension des changements lipidiques lors de l’incubation du plasma, ce qui ouvre la voie à la découverte de biomarqueurs.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,006 | 0,004 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».