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Record W2886377920 · doi:10.71781/29466

Mesure de l’activité de la lécithine : cholestérol acyltransférase (LCAT), une enzyme impliquée dans la biogenèse des HDL, par chromatographie liquide - spectrométrie de masse (LC-MS)

2018· dissertation· fr· W2886377920 on OpenAlexaboutno aff
Matthieu Blanchard

Bibliographic record

VenuePapyrus : Institutional Repository (Université de Montréal) · 2018
Typedissertation
Languagefr
FieldChemistry
TopicAnalytical Methods in Pharmaceuticals
Canadian institutionsnot available
Fundersnot available
KeywordsChemistryMolecular biologyBiology

Abstract

fetched live from OpenAlex

La lécithine : cholestérol acyltransférase, ou LCAT, est la seule enzyme plasmatique capable d’estérifier le cholestérol des lipoprotéines circulantes, une fonction importante dans la biogenèse des lipoprotéines de haute densité HDL et le transport inverse du cholestérol. Son activité est définie comme le taux d’estérification fractionnel du cholestérol libre (CL) des HDL (FERHDL). Le FERHDL est un biomarqueur candidat du risque cardiovasculaire. La réaction d’estérification implique l’hydrolyse d’un acide gras estérifié à la phosphatidylcholine (PC) et son transfert au CL, résultant en la formation d’un ester de cholestérol (CE) et d’une lysophosphatidylcholine (LPC). L’objectif de ce travail était de faire la preuve de concept d’une nouvelle méthode de mesure de l’activité LCAT par chromatographie liquide couplée à un spectromètre de masse (LC-MS), qui permet d’identifier et quantifier simultanément tous les substrats et produits de la LCAT. Avec la méthode LC-MS, il a été possible de mesurer le FERHDL comme avec la méthode enzymatique (méthode de référence pour le cholestérol libre), mais aussi des changements au niveau de lipides spécifiques. Les LPC étaient de bons marqueurs candidat de l’activité LCAT, leur abondance étant augmentée de plus de 40% suite à l’incubation. L’activité LCAT a aussi été mesurée dans des plasmas humains enrichis de plusieurs doses de LCAT humaine recombinante et les doses de 4 et 8 μg/mL suffisaient à produire des différences significatives, comparées au plasma natif, pour 5 espèces lipidiques outre le CL: les LPC(16:0) et LPC(18:0) et les PC(14:0|18:2), PC(16:0|16:1) et PC(16:0|18:0). Enfin, l’analyse de l’activité LCAT sur des échantillons de plasma humain de la Biobanque de l’Institut de Cardiologie de Montréal (50 témoins et 50 cas ayant une maladie coronarienne athérosclérotique) a permis d’étudier la modulation des espèces lipidiques dans des échantillons plus complexes qu’un groupe de plasma. De ces lipides, la PC(34 :3) était particulièrement intéressante. Son abondance était plus diminuée par l’incubation du plasma à 37°C chez les cas que chez les témoins, ce qui en fait un candidat comme biomarqueur de l’activité de la LCAT. L’application de la LC-MS à l’étude de la LCAT permet donc une meilleure compréhension des changements lipidiques lors de l’incubation du plasma, ce qui ouvre la voie à la découverte de biomarqueurs.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame distilled prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. Learned from the 10,348 direct Codex labels and 10,348 direct Gemma labels. Candidate is the union of thresholded teacher heads; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels or direct frontier model labels.

metaresearch head score (Codex)0.002
metaresearch head score (Gemma)0.001
Version: codex-gemma-dda1882f352aValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesMeta-epidemiology (narrow), Science and technology studies, Research integrity
Consensus categoriesMeta-epidemiology (narrow), Science and technology studies, Research integrity
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Bench or experimental · Consensus signal: Bench or experimental
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.047
Threshold uncertainty score1.000

Codex and Gemma teacher scores by category

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0020.001
Meta-epidemiology (narrow)0.0010.002
Meta-epidemiology (broad)0.0010.001
Bibliometrics0.0010.001
Science and technology studies0.0060.004
Scholarly communication0.0000.001
Open science0.0020.000
Research integrity0.0030.002
Insufficient payload (model declined to judge)0.0000.000

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.009
GPT teacher head0.252
Teacher spread0.243 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; both teacher heads agree on what is shown here.

Study designBench or experimental
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

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Citations0
Published2018
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