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Enregistrement W2886522468 · doi:10.1158/1538-7445.am2018-3673

Abstract 3673: Targeting the epigenome of small cell hypercalcemic carcinoma of the ovary, hypercalcemic type (SCCOHT)

2018· article· en· W2886522468 sur OpenAlexaff
Yemin Wang, Shary Yuting Chen, Shane Colborne, Krystal A. Orlando, Jessica D. Lang, Anthony N. Karnezis, William P.D. Hendricks, Gregg B. Morin, Bernard E. Weissman, Jeffrey M. Trent, David G. Huntsman

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChromatin Remodeling and Cancer
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSMARCA4BiologyEpigenomeCancer researchChromatin remodelingEZH2ChromatinEpigeneticsCell cycle checkpointHistoneCell cycleCell biologyCancerGeneticsDNA methylationGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Small cell carcinoma of the ovary hypercalcemic type (SCCOHT) is a rare and poorly differentiated cancer that impacts young women with an average 2-year survival of less than 35%. We and others have discovered the inactivating mutations of SMARCA4 as the only consistent genetic alternation in SCCOHT genomes. SMARCA4 is the ATPase of the SWI/SNF chromatin-remodeling complex, which modulates chromatin accessibility to regulate transcription and plays critical roles in many biologic processes such as cell cycle control, apoptosis, and differentiation. SCCOHT also lacks the expression of SMARCA2, the alternative ATPase in the complex, contrasting the requirement of SMARCA2 for survival of most SMARCA4-deficient cancer cells. This suggest that the complete loss of chromatin-remodeling activity may rewire the epigenome and create opportunities for synthetic lethal targeting. A rational epigenetic drug screen identified EZH2 inhibitors and HDAC inhibitors as promising therapeutic agents in SCCOHT cells. We confirm that catalytic inhibition of EZH2 selectively suppressed the growth of SCCOHT cells in vitro and in xenograft models through activation of apoptosis and differentiation. Pan-HDAC inhibitors also displayed a more robust anticancer effect in SCCOHT cells than other in other ovarian cancer cell lines. Furthermore, combined treatment of EZH2 inhibitors and pan-HDAC inhibitors increased the global acetylation level at histone H3K27 site and synergistically suppressed the growth of SCCOHT cell lines and xenografts through robust induction of apoptosis. Although EZH2 or HDAC inhibitor treatment led to re-expression of SMARCA2, depletion of SMARCA2 had only minimal effect on drug response. Proteomic analysis identified key signaling pathways underlying the efficacy of epigenetic therapy that are under investigation. Therefore, inactivation of SWI/SNF chromatin remodeling complex may drive SCCOHT development through PRC2-dependent rewiring of the epigenome. Targeting these oncogenic events can be the feasible strategies for treatment of SCCOHT that warrant clinical investigation. Citation Format: Yemin Wang, Shary Yu-ting Chen, Shane Colborne, Krystal Orlando, Jessica Lang, Anthony Karnezis, William Hendricks, Gregg Morin, Bernard Weissman, Jeffrey Trent, David Huntsman. Targeting the epigenome of small cell hypercalcemic carcinoma of the ovary, hypercalcemic type (SCCOHT) [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2018; 2018 Apr 14-18; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2018;78(13 Suppl):Abstract nr 3673.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,341
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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