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Enregistrement W2886579953 · doi:10.1111/mpp.12742

Redox signalling from NADPH oxidase targets metabolic enzymes and developmental proteins in <i>Fusarium graminearum</i>

2018· article· en· W2886579953 sur OpenAlexaff
Ursla Fernando, Salima Chatur, Manisha Joshi, Christopher Bonner, Tao Fan, Keith Hubbard, Denise Chabot, Owen Rowland, Li Wang, Rajagopal Subramaniam, Christof Rampitsch

Notice bibliographique

RevueMolecular Plant Pathology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueNeutrophil, Myeloperoxidase and Oxidative Mechanisms
Établissements canadiensCarleton UniversityAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyNADPH oxidaseBiochemistryCysteineEnzymeReactive oxygen speciesSerine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary NADPH oxidase (NOX) is one of the sources of reactive oxygen species (ROS) that modulates the activity of proteins through modifications of their cysteine residues. In a previous study, we demonstrated the importance of NOX in both the development and pathogenicity of the phytopathogen Fusarium graminearum . In this article, comparative proteomics between the wild‐type and a Nox mutant of F. graminearum was used to identify active cysteine residues on candidate redox‐sensing proteins. A two‐dimensional gel approach based on labelling with monobromobimane (mBBR) identified 19 candidate proteins, and was complemented with a gel‐free shotgun approach based on a biotin switch method, which yielded 99 candidates. The results indicated that, in addition to temporal regulation, a large number of primary metabolic enzymes are potentially targeted by NoxAB ‐generated ROS. Targeted disruption of these metabolic genes showed that, although some are dispensable, others are essential. In addition to metabolic enzymes, developmental proteins, such as the Woronin body major protein (FGSG_08737) and a glycosylphosphatidylinositol (GPI)‐anchored protein (FGSG_10089), were also identified. Deletion of either of these genes reduced the virulence of F. graminearum . Furthermore, changing the redox‐modified cysteine (Cys 325 ) residue in FGSG_10089 to either serine or phenylalanine resulted in a similar phenotype to the FGSG_ 10089 knockout strain, which displayed reduced virulence and altered cell wall morphology; this underscores the importance of Cys 325 to the function of the protein. Our results indicate that NOX‐generated ROS act as intracellular signals in F. graminearum and modulate the activity of proteins affecting development and virulence in planta .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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