Light-responsive bicyclic peptides
Notice bibliographique
Résumé
In this paper, we describe a method for the synthesis of light-responsive (LR) bicyclic macrocycles from linear peptides composed of 20 natural amino acids. Small molecules, peptide macrocycles, and protein conjugates that reversibly turn their function on and off in response to visible light enabled the fields of photopharmacology and optochemical genetics. Bioactive LR molecules could be produced by grafting azobenzene or other LR-structures onto molecules with known biological functions (e.g., alpha-helical peptides). It is also possible to discover such LR ligands de novo by selecting compounds with a desired function-such as binding to a target-from a library of LR-compounds or a genetically-encoded (GE) library of LR-macrocycles. The bicyclic topology of ligands offers added value such as improved binding and stability when compared to monocyclic peptides, but approaches for the design of bicyclic light-responsive architectures are limited. To address this need, we developed a tridentate C2-symmetric hydroxyl amine and di-chlorobenzene containing azobenzene (HADCAz) LR-linker with two orthogonally reactive functionalities (chlorobenzyl and hydroxylamine) to convert a linear unprotected peptide into a bicyclic peptide in a one-pot, two-step reaction. This linker reversibly isomerizes from the trans to cis form upon irradiation with blue light (365 nm). The resulting bicyclic peptide contains two loops of amino acids, one of which is constrained with an azobenzene moiety that can change the conformation in response to visible light. A scalable synthetic route to the HADCAz linker allowed us to demonstrate its application in multiple synthetic bicyclic peptides with loops that contain 2-5 amino acids.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,008 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».