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Enregistrement W2887514374 · doi:10.1534/g3.118.200374

Acute Effects of Drugs on <i>Caenorhabditis elegans</i> Movement Reveal Complex Responses and Plasticity

2018· article· en· W2887514374 sur OpenAlexafffund
Mark Spensley, Samantha Del Borrello, Djina Pajkic, Andrew Fraser

Notice bibliographique

RevueG3 Genes Genomes Genetics · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésDrugPharmacologyBiologyCaenorhabditis elegansNeuroscienceParalysisNeurotransmitterHormesisMedicineCentral nervous systemEndocrinologyOxidative stress

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Many drugs act very rapidly — they can turn on or off their targets within minutes in a whole animal. What are the acute effects of drug treatment and how does an animal respond to these? We developed a simple assay to measure the acute effects of drugs on C. elegans movement and examined the effects of a range of compounds including neuroactive drugs, toxins, environmental stresses and novel compounds on worm movement over a time period of 3 hr. We found a wide variety of acute responses. Many compounds cause rapid paralysis which may be permanent or followed by one or more recovery phases. The recoveries are not the result of some generic stress response but are specific to the drug e.g., recovery from paralysis due to a neuroactive drug requires neurotransmitter pathways whereas recovery from a metabolic inhibitor requires metabolic changes. Finally, we also find that acute responses can vary greatly across development and that there is extensive natural variation in acute responses. In summary, acute responses are sensitive probes of the ability of biological networks to respond to drug treatment and these responses can reveal the action of unexplored pathways.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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