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Enregistrement W2889486741 · doi:10.1101/403733

<i>Zfp189</i> Mediates Stress Resilience Through a CREB-Regulated Transcriptional Network in Prefrontal Cortex

2018· preprint· en· W2889486741 sur OpenAlexaff
Zachary S. Lorsch, Peter J. Hamilton, Aarthi Ramakrishnan, Eric M. Parise, William J. Wright, Marine Salery, Ashley E. Lepack, Philipp Mews, Orna Issler, Andrew McKenzie, Xianxiao Zhou, Lyonna F. Parise, Stephen T. Pirpinias, Idelisse Ortiz Torres, Sarah Montgomery, Yong‐Hwee Eddie Loh, Benoît Labonté, Andrew P. Conkey, Ann E. Symonds, Rachael L. Neve, Gustavo Turecki, Ian Maze, Yan Dong, Bin Zhang, Li Shen, Rosemary C. Bagot, Eric J. Nestler

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNuclear Receptors and Signaling
Établissements canadiensMcGill UniversityDouglas Mental Health University InstituteUniversité Laval
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthHope for Depression Research Foundation
Mots-clésCREBRegulatorNeurosciencePrefrontal cortexBiologyTranscriptional regulationTranscriptomeReprogrammingRegulation of gene expressionCell biologyGene expressionTranscription factorGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Stress resilience involves numerous brain-wide transcriptional changes. Determining the organization and orchestration of these transcriptional events may reveal novel antidepressant targets, but this remains unexplored. Here, we characterize the resilient transcriptome with co-expression analysis and identify a single transcriptionally-active uniquely-resilient gene network. Zfp189 , a previously unstudied zinc finger protein, is the top network key driver and its overexpression in prefrontal cortical (PFC) neurons preferentially activates this network, alters neuronal activity and promotes behavioral resilience. CREB, which binds Zfp189 , is the top upstream regulator of this network. To probe CREB- Zfp189 interactions as a network regulatory mechanism, we employ CRISPR-mediated locus-specific transcriptional reprogramming to direct CREB selectively to the Zfp189 promoter. This single molecular interaction in PFC neurons recapitulates the pro-resilient Zfp189- dependent downstream effects on gene network activity, electrophysiology and behavior. These findings reveal an essential role for Zfp189 and a CREB- Zfp189 regulatory axis in mediating a central transcriptional network of resilience.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,164
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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