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Enregistrement W2890401619 · doi:10.1101/415794

Bacterial outer membrane vesicles provide an alternative pathway for trafficking of type III secreted effectors into epithelial cells

2018· preprint· en· W2890401619 sur OpenAlexaff
Natalie Sirisaengtaksin, Eloise J. O’Donoghue, Sara Jabbari, Andrew J. Roe, Anne Marie Krachler

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilDirectorate for Biological SciencesNational Institutes of Health
Mots-clésEffectorIntiminSecretionType three secretion systemBiologyBacterial outer membraneCell biologyVesicleMicrobiologyVirulenceEscherichia coliEnterobacteriaceaeBiochemistryMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Outer membrane vesicles (OMVs) are proteo-liposomes universally shed by Gram-negative bacteria. Their secretion is significantly enhanced by the transition into the intra-host milieu and OMVs have been shown to play critical roles during pathogenesis. Enterohemorrhagic Escherichia coli O157 (EHEC), causes diarrheal disease in humans, and soluble toxins including Shiga-like toxins that contribute to disease severity and clinical complications including hemolytic uremic syndrome, have been shown to be OMV associated. In addition to Shiga-like toxins, EHEC produces a type III secretion system (T3SS), and T3SS effectors are associated with colonization and disease severity in vivo . Here, we show that type III secreted substrates including translocators and effectors are incorporated into OMVs independent of type III secretion activity. EHEC strains with non-functional type III secretion systems shed more OMVs and vesicles enter host cells with accelerated kinetics compared to vesicles shed from wild type EHEC. The T3SS effector translocated intimin receptor (Tir) is trafficked from OMVs into host cells and localizes to the membrane. However, its clustering on the host membrane and co-localization with bacterial pedestals is intimin-dependent. We further show that OMV-delivered Tir can cross-complement an effector-deficient EHEC strain, demonstrating that OMV-associated effectors reach the host cell in a biologically intact form. Finally, we observe that the non-LEE encoded E3 ubiquitin ligase effector NleL is also trafficked to host cells via OMVs, where it ubiquitinylates its target kinase JNK. Together, these data demonstrate that trafficking of OMV-associated effectors is a novel and T3SS-independent pathway for the delivery of active effectors to host cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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