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Enregistrement W2890785725 · doi:10.3389/fphys.2018.01406

Eukaryotic Voltage-Gated Sodium Channels: On Their Origins, Asymmetries, Losses, Diversification and Adaptations

2018· article· en· W2890785725 sur OpenAlexafffund
Julia Fux, Amrit Mehta, Jack Moffat, J. David Spafford

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Physiology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine Invertebrate Physiology and Ecology
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésGatingSodium channelIon channelBiologyTransmembrane domainBiophysicsCell biologyBiochemistryChemistryGeneSodiumReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Appearance of highly sodium selective voltage-gated sodium channels with rapid gating kinetics was a limiting factor in the evolution of nervous systems. Two rounds of domain duplications in a basal eukaryote generated a common ion channel template that is shared amongst voltage-gated sodium (Nav1, Nav2) and calcium channels (Cav1, Cav2, Cav3). Conservation of intron splice junctions in the first domain, including a rare U12-type from the minor spliceosome provides support for a shared, distant heritage of sodium and calcium channels. The consequences of a 4x6 transmembrane domain configuration is the emergence of a uniquely asymmetrical domains with a shared architecture. This configuration permits a highly changeable ion selectivity from calcium to sodium ion selectivity by means of a single lysine residue change in the high field strength site of the ion selectivity filter. A non-selective, and slowly-gating Nav2 channel appearing in single cell eukaryotes before the split of animals and fungi, evolved into ten Nav1.x channel genes specialized for vertebrate tissues. A close kinship is evident in the sharing of most intron splice junctions between Nav2 and Nav1 channels. Multicellularity and the appearance of nervous systems was an impetus for Nav1 channels to adapt to high sodium ion selectivity and fast ion gating. Specific nervous system adaptations include a capacity for modulation by protein kinase phosphorylation and tethering elements to protein assemblies in First Initial Segments and nodes of Ranvier. Associated with the novel niches filled by Nav1 channels in metazoans is the convergent evolution of completely differing sets of accessory Navβ subunits in different animal phyla or sub-phyla. Navβ subunits contribute to trafficking and stabilization of Nav1 channels to specialized nerve membrane locales. Navβ subunit isoforms serve as cell adhesion molecules tethering to elements to the extracellular matrix, and contribute to developmental functions such as nerve outgrowth and axon migration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,076
Score d'incertitude au seuil0,733

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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