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Enregistrement W2891267158 · doi:10.1186/s13063-018-2877-z

The Comparative Effectiveness of Innovative Treatments for Cancer (CEIT-Cancer) project: Rationale and design of the database and the collection of evidence available at approval of novel drugs

2018· article· en· W2891267158 sur OpenAlexaff
Aviv Ladanie, Benjamin Speich, Florian Naudet, Arnav Agarwal, Tiago Pereira, Francesco Sclafani, Juan Martín-Liberal, Thomas Schmid, Hannah Ewald, John P. A. Ioannidis, Heiner C. Bucher, Benjamin Kasenda, Lars G. Hemkens

Notice bibliographique

RevueTrials · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueStatistical Methods in Clinical Trials
Établissements canadiensCanada Research ChairsMcMaster UniversityUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesKrebsliga SchweizLaura and John Arnold Foundation
Mots-clésMedicineComparative effectiveness researchResearch designDrug approvalAlternative medicinePharmacologyDrugPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The available evidence on the benefits and harms of novel drugs and therapeutic biologics at the time of approval is reported in publicly available documents provided by the US Food and Drug Administration (FDA). We aimed to create a comprehensive database providing the relevant information required to systematically analyze and assess this early evidence in meta-epidemiological research. METHODS: We designed a modular and flexible database of systematically collected data. We identified all novel cancer drugs and therapeutic biologics approved by the FDA between 2000 and 2016, recorded regulatory characteristics, acquired the corresponding FDA approval documents, identified all clinical trials reported therein, and extracted trial design characteristics and treatment effects. Herein, we describe the rationale and design of the data collection process, particularly the organization of the data capture, the identification and eligibility assessment of clinical trials, and the data extraction activities. DISCUSSION: We established a comprehensive database on the comparative effects of drugs and therapeutic biologics approved by the FDA over a time period of 17 years for the treatment of cancer (solid tumors and hematological malignancies). The database provides information on the clinical trial evidence available at the time of approval of novel cancer treatments. The modular nature and structure of the database and the data collection processes allow updates, expansions, and adaption for a continuous meta-epidemiological analysis of novel drugs. The database allows us to systematically evaluate benefits and harms of novel drugs and therapeutic biologics. It provides a useful basis for meta-epidemiological research on the comparative effects of innovative cancer treatments and continuous evaluations of regulatory developments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,145
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,331
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,145
Score d'incertitude au seuil0,767

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1450,331
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0060,006
Bibliométrie0,0210,031
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0100,004
Science ouverte0,0070,007
Intégrité de la recherche0,0040,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,886
Tête enseignante GPT0,636
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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