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Enregistrement W2891740056 · doi:10.71781/30261

Examining how PSMB11 orchestrates T cell development

2017· dissertation· en· W2891740056 sur OpenAlexfundno aff
Anca Apavaloaei

Notice bibliographique

RevuePapyrus : Institutional Repository (Université de Montréal) · 2017
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésBiologyPolitical scienceCognitive sciencePsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Les lymphocytes T CD8 jouent un rôle majeur dans l’immunosurveillance de l’organisme contre les pathogènes de même que les cellules pré-cancéreuses. Afin d’induire une réponse cytotoxique efficace contre ces événements anormaux, les lymphocytes T CD8 doivent exprimer à leur surface un récepteur des cellules T (TCR) qualifié et capable de reconnaître les molécules étrangères. Cette qualification s’effectue au sein du thymus, qui représente l’unique organe se spécialisant dans l’éducation des lymphocytes T CD4 et CD8. Dans le cortex thymique, les thymocytes exprimant un TCR fonctionnel sont sélectionnés positivement par les cellules épithéliales corticales thymiques (cTECs). Ceux-ci transitent ensuite vers la médulla thymique où les thymocytes autoréactifs sont éliminés afin de prévenir l’autoimmunité. PSMB11 est une sous-unité catalytique du thymoprotéasome, qui est exprimé de façon exclusive par les cTECs, des cellules spécialisées dans la production et la présentation des peptides associés au CMH de classe I (MIPs). Ainsi, une déficience en PSMB11 altère sévèrement le développement des thymocytes CD8. Étant donné que les thymoprotéasomes présentent une faible activité chymotrypsique, leur rôle présumé est de produire des peptides ayant une faible affinité pour le CMH de classe I pour ainsi assurer la sélection positive des thymocytes CD8 exprimant un TCR de faible affinité. À ce jour, aucune étude n’a toutefois réussi à élucider le rôle fondamental de PSMB11 dans la sélection positive. Puisque les protéasomes peuvent être impliqués dans plusieurs processus cellulaires, nous avons vérifié si PSMB11 1) orchestre des activités peptide-indépendantes dans les cTECs, et 2) son impact sur le développement des thymocytes. Nous avons montré que les cTECs de souris Psmb11-/- présentent une expression différentielle de gènes impliqués dans l’adhésion cellule-cellule ainsi que dans la signalisation des cytokines, deux processus étroitement liés à la sélection positive. Nous avons également observé des niveaux élevés de CXCR4 à la surface des thymocytes 8SM des souris Psmb11–/–, suggérant que les thymocytes CD8 sont retenus plus longtemps dans le cortex comparativement aux souris WT. Des gènes pro-inflammatoires sont aussi surexprimés dans les cTECs déficientes en PSMB11, menant à la détection d’une augmentation du stress dans les thymocytes. Enfin, nous avons montré que PSMB11 altère l’expression de Cd83 et Prss16, deux gènes ayant un rôle essentiel dans le développement des lymphocytes T CD4. En conclusion, notre étude dévoile un tout nouveau rôle de PSMB11 dans le développement des lymphocytes CD4 et CD8, soit l’orchestration de la transcription des gènes au sein des cTECs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,186
Écart entre enseignants0,173 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
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