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Enregistrement W2891752203 · doi:10.3389/fmicb.2018.01990

Bacterial Subspecies Variation and Nematode Grazing Change P Dynamics in the Wheat Rhizosphere

2018· article· en· W2891752203 sur OpenAlexafffundabout
Usman Irshad, Étienne Yergeau

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueNematode management and characterization studies
Établissements canadiensInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésRhizosphereBiologyRhizobacteriaPseudomonasGrazingMicrocosmPhosphorusTrophic levelAbundance (ecology)BacteriaAgronomyBotanyEcologyChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Low phosphorus soils are thought to constitute the majority of soils worldwide and cannot support intensive agriculture without high fertilizer inputs. Rhizospheric Rhizobacteria are well-known to modify P dynamics, and an increased bacterial diversity normally has a positive impact on process rate. However, it is not well known how variation in bacterial diversity at the subspecies level could influence trophic interactions in the rhizosphere and its consequences on plant P nutrition. We therefore hypothesized that the interactions between closely related P solubilizing bacteria and their grazing nematodes could improve plant P dynamics from an unavailable P source. We isolated four Pseudomonas poae strains and extracted nematodes from a Saskatchewan wheat field soil sample. The potential of all bacterial isolates and with and without nematodes combinations for increasing P availability in the wheat rhizosphere was tested in controlled microcosms with Ca3(PO4)2 as sole P source. Liberated P, phosphatase activity, plant P and bacterial abundance based upon phnX gene copies were determined. Phosphorus solubilization efficiency of isolates varied as P. poae 1 >P. poae 2 > P. poae 3 > P. poae 4, respectively whereas phosphatase enzyme activity was only detected under nematodes grazing and during the first 15 days of the experiment. Nematodes grazing upon individual Pseudomonas poae increased phosphatase enzyme activity, bacterial abundance, but decreased plant P concentration compared to non-grazed system. In contrast, the treatment combining all Pseudomonas poae isolates together with nematodes resulted in significant increases in P availability and plant P concentration. Diverse P-solubilizing efficiency and interaction with nematodes within the same bacterial “species” suggest that P dynamics might be linked to micro variation in soil diversity that would not accurately be picked up using common tools such as 16S rRNA gene sequencing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,224
Score d'incertitude au seuil0,373

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2018
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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