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Enregistrement W2891882631 · doi:10.15252/emmm.201809155

Systematic pharmacological screens uncover novel pathways involved in cerebral cavernous malformations

2018· article· en· W2891882631 sur OpenAlexafffund
Cécile Otten, Jessica Knox, Gwénola Boulday, Mathias Eymery, Marta Haniszewski, Martin Neuenschwander, Silke Radetzki, Ingo Vogt, Kristina Hähn, Coralie De Luca, Cécile Cardoso, Sabri Hamad, Carla Igual Gil, Peter J. Roy, Corinne Albigès‐Rizo, Eva Faurobert, Jens Peter von Kries, Mónica Campillos, Elisabeth Tournier‐Lasserve, W. Brent Derry, Salim Abdelilah‐Seyfried

Notice bibliographique

RevueEMBO Molecular Medicine · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueVascular Malformations Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAgence Nationale de la RechercheFondation pour la Recherche MédicaleDeutsche ForschungsgemeinschaftE-Rare
Mots-clésLibrary scienceGermanArt historyArtHistoryComputer scienceArchaeology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cerebral cavernous malformations (CCMs) are vascular lesions in the central nervous system causing strokes and seizures which currently can only be treated through neurosurgery. The disease arises through changes in the regulatory networks of endothelial cells that must be comprehensively understood to develop alternative, non‐invasive pharmacological therapies. Here, we present the results of several unbiased small‐molecule suppression screens in which we applied a total of 5,268 unique substances to CCM mutant worm, zebrafish, mouse, or human endothelial cells. We used a systems biology‐based target prediction tool to integrate the results with the whole‐transcriptome profile of zebrafish CCM2 mutants, revealing signaling pathways relevant to the disease and potential targets for small‐molecule‐based therapies. We found indirubin‐3‐monoxime to alleviate the lesion burden in murine preclinical models of CCM2 and CCM3 and suppress the loss‐of‐CCM phenotypes in human endothelial cells. Our multi‐organism‐based approach reveals new components of the CCM regulatory network and foreshadows novel small‐molecule‐based therapeutic applications for suppressing this devastating disease in patients. Currently, the only treatment for cerebral cavernous malformation (CCM) vasculature lesions is surgery. This study by Otten et al establishes a multi‐organismal pharmacological approach to suppress the formation of new lesions or to regress existing ones. Currently, the only treatment for cerebral cavernous malformation (CCM) vasculature lesions is surgery. This study by Otten et al establishes a multi‐organismal pharmacological approach to suppress the formation of new lesions or to regress existing ones.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,372
Score d'incertitude au seuil0,833

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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