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Enregistrement W2892303659 · doi:10.1093/toxsci/kfy230

Genomic Profiling of BDE-47 Effects on Human Placental Cytotrophoblasts

2018· article· en· W2892303659 sur OpenAlexfundno aff
Joshua F. Robinson, Mirhan Kapidzic, Emily G. Hamilton, Hao Chen, Kenisha W Puckett, Yan Zhou, Katherine Ona, Emily Parry, Yunzhu Wang, June-Soo Park, J Costello, Susan J. Fisher

Notice bibliographique

RevueToxicological Sciences · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBirth, Development, and Health
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentMcMaster UniversityNational Institute of Environmental Health SciencesDepartment of Toxic Substances ControlU.S. Environmental Protection Agency
Mots-clésTranscriptomePlacentaBiologyPolybrominated diphenyl ethersPlacentationDNA methylationCell biologyFetusAndrologyEndocrinologyPregnancyGene expressionGeneticsMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Despite gradual legislative efforts to phase out flame retardants (FRs) from the marketplace, polybrominated diphenyl ethers (PBDEs) are still widely detected in human maternal and fetal tissues, eg, placenta, due to their continued global application in consumer goods and inherent biological persistence. Recent studies in rodents and human placental cell lines suggest that PBDEs directly cause placental toxicity. During pregnancy, trophoblasts play key roles in uterine invasion, vascular remodeling, and anchoring of the placenta-fetal unit to the mother. Thus, to study the potential consequences of PBDE exposures on human placental development, we used an in vitro model: primary villous cytotrophoblasts (CTBs). Following exposures, the endpoints that were evaluated included cytotoxicity, function (migration, invasion), the transcriptome, and the methylome. In a concentration-dependent manner, common PBDE congeners, BDE-47 and -99, significantly reduced cell viability and increased death. Upon exposures to sub-cytotoxic concentrations (≤ 5 µM), we observed BDE-47 accumulation in CTBs with limited evidence of metabolism. At a functional level, BDE-47 hindered the ability of CTBs to migrate and invade. Transcriptomic analyses of BDE-47 effects suggested concentration-dependent changes in gene expression, involving stress pathways, eg, inflammation and lipid/cholesterol metabolism as well as processes underlying trophoblast fate, eg, differentiation, migration, and vascular morphogenesis. In parallel assessments, BDE-47 induced low-level global increases in methylation of CpG islands, including a subset that were proximal to genes with roles in cell adhesion/migration. Thus, using a primary human CTB model, we showed that PBDEs induced alterations at cellular and molecular levels, which could adversely impact placental development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,557
Score d'incertitude au seuil0,311

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,070
Tête enseignante GPT0,366
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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