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Enregistrement W2893391390 · doi:10.1016/j.scr.2018.09.011

Generation of integration-free iPS cell lines from three sickle cell disease patients from the state of Bahia, Brazil

2018· article· en· W2893391390 sur OpenAlexfundno aff
Gabriele Louise Soares Martins, Bruno Diaz Paredes, Carine Machado Azevedo, Gabriela Louise de Almeida Sampaio, Carolina Kymie Vasques Nonaka, Bruno Raphael Ribeiro Cavalcante, Kátia Nunes da Silva, Ciro Silveira Pereira, Milena Botelho Pereira Soares, Ricardo Ribeiro dos Santos, Bruno Solano de Freitas Souza

Notice bibliographique

RevueStem Cell Research · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFundação de Amparo à Pesquisa do Estado da BahiaInstituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Medicina RegenerativaMinistry of Health, British ColumbiaConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Mots-clésBiologyInduced pluripotent stem cellReprogrammingDiseasePeripheral blood mononuclear cellKaryotypeGerm layerCellCell cultureImmunologyCancer researchEmbryonic stem cellGeneGeneticsInternal medicineChromosomeMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sickle cell disease (SCD) is one of the most prevalent and severe monogenetic disorders, affecting several million people around the world. Clinical manifestations and complications of the disease include sickle cell pain crisis, silent cerebral infarct, stroke, nephropathy and early death. In this study, we generated induced pluripotent stem cell (iPSC) lines from three homozygous SCD patients from the state of Bahia, Brazil, where SCD is highly prevalent. Peripheral blood mononuclear cells were collected and erythroblasts were expanded for cell reprogramming with the use of non-integrative episomal vectors. The generated iPSC lines expressed high levels of pluripotency markers, presented a normal karyotype and were able to differentiate into the three germ layers in embryoid body spontaneous differentiation assays. Moreover, the expression of the episomal vectors was lost in all iPSC lines after 15 passages. These iPSC lines may help increasing the knowledge about SCD pathogenesis and can be a useful tool for drug testing and gene editing studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,389

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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