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Enregistrement W2893677234 · doi:10.1161/circ.132.suppl_3.15465

Abstract 15465: Precision Medicine Approach to Resistant Hypertension: Genetic Markers of Resistant Hypertension Through a Genome-wide Association Study (GWAS) in the Secondary Prevention of Subcortical Strokes (SPS3)

2015· article· en· W2893677234 sur OpenAlexaff
Nihal El Rouby, Caitrin W. McDonough, Yan Gong, Leslie A. McClure, Braxton D. Mitchell, Richard B. Horenstein, Robert L. Talbert, Atsushi Takahashi, Toshihiro Tanaka, Michiaki Kubo, Carl J. Pepine, Rhonda M. Cooper‐DeHoff, Oscar Benavente, Alan R. Shuldiner, Julie A. Johnson

Notice bibliographique

RevueCirculation · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNutrition, Genetics, and Disease
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineGenome-wide association studySingle-nucleotide polymorphismInternal medicineGenetic associationBioinformaticsOncologyGeneticsGenotypeGeneBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Resistant hypertension (RHTN), a blood pressure (BP) ≥140/90 mm Hg despite ≥ 3 antihypertensive drugs or BP < 140/90 mm Hg using ≥ 4 drugs, is associated with increased incidence of adverse cardiovascular outcomes, especially stroke. Hypothesis and objective: We hypothesize common variants exist in the genes regulating BP response and may lead to RHTN in some patients. Methods: A discovery cohort of hypertensive participants were included as cases (as defined above) or controls (N=719; 263 whites, 322 Hispanics, and 134 African Americans) from SPS3-GENES. They were genotyped on the Illumina Omni 5 Exome chip. Multiple logistic regression analysis was conducted separately in each race using an additive genetic model, adjusting for predictors for RHTN, principle components for ancestry and BP target treatment arms. Results from the 3 racial groups were combined using meta-analysis with inverse-variance weighting, with the hypothesis that functional variants are consistent across races. The associations of seven SNPs that met the suggestive level of association (p <1 x10-5) in the SPS3 meta-analysis were tested for replication in 1,194 participants (657 whites, and 537 Hispanics) from the INternational VErapamil-SR trandolapril STudy GENEtic Substudy (INVEST-GENES). Bonferroni adjusted p was set at 0.007 to correct for multiple comparisons. Combined meta-analysis between INVEST and SPS3 was conducted for replicated SNPs or SNPs that had consistent association in the two cohorts with a nominal significance. Results: A missense SNP (rs3766160; Asp114Asn) in CELA2B was associated with increased risk of RHTN in SPS3 (Combined OR=1.8, p=6x10-6)). The same SNP replicated in INVEST (Combined OR=1.3, p=0.004; INVEST/SPS3 meta-p=4.5x10-7). An intronic SNP rs3789592 in strong linkage disequilibrium (r2=0.98) with a missense SNP (rs1049434; Asp490Glu) in SLC16A1 was associated with RHTN in SPS3 (Combined OR=2.0, p=7.6x10-7) and had a consistent association in INVEST (Combined OR=1.2, p=0.048; INVEST/SPS3 meta-p=7.6x10-7). Conclusion: Genetic loci in CELA2B, SLC16A1 were identified and confirmed for association in two cohorts. These associations, if further validated may help identify those patients at risk for RHTN.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,026

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,003
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
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