Abstract 15465: Precision Medicine Approach to Resistant Hypertension: Genetic Markers of Resistant Hypertension Through a Genome-wide Association Study (GWAS) in the Secondary Prevention of Subcortical Strokes (SPS3)
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: Resistant hypertension (RHTN), a blood pressure (BP) ≥140/90 mm Hg despite ≥ 3 antihypertensive drugs or BP < 140/90 mm Hg using ≥ 4 drugs, is associated with increased incidence of adverse cardiovascular outcomes, especially stroke. Hypothesis and objective: We hypothesize common variants exist in the genes regulating BP response and may lead to RHTN in some patients. Methods: A discovery cohort of hypertensive participants were included as cases (as defined above) or controls (N=719; 263 whites, 322 Hispanics, and 134 African Americans) from SPS3-GENES. They were genotyped on the Illumina Omni 5 Exome chip. Multiple logistic regression analysis was conducted separately in each race using an additive genetic model, adjusting for predictors for RHTN, principle components for ancestry and BP target treatment arms. Results from the 3 racial groups were combined using meta-analysis with inverse-variance weighting, with the hypothesis that functional variants are consistent across races. The associations of seven SNPs that met the suggestive level of association (p <1 x10-5) in the SPS3 meta-analysis were tested for replication in 1,194 participants (657 whites, and 537 Hispanics) from the INternational VErapamil-SR trandolapril STudy GENEtic Substudy (INVEST-GENES). Bonferroni adjusted p was set at 0.007 to correct for multiple comparisons. Combined meta-analysis between INVEST and SPS3 was conducted for replicated SNPs or SNPs that had consistent association in the two cohorts with a nominal significance. Results: A missense SNP (rs3766160; Asp114Asn) in CELA2B was associated with increased risk of RHTN in SPS3 (Combined OR=1.8, p=6x10-6)). The same SNP replicated in INVEST (Combined OR=1.3, p=0.004; INVEST/SPS3 meta-p=4.5x10-7). An intronic SNP rs3789592 in strong linkage disequilibrium (r2=0.98) with a missense SNP (rs1049434; Asp490Glu) in SLC16A1 was associated with RHTN in SPS3 (Combined OR=2.0, p=7.6x10-7) and had a consistent association in INVEST (Combined OR=1.2, p=0.048; INVEST/SPS3 meta-p=7.6x10-7). Conclusion: Genetic loci in CELA2B, SLC16A1 were identified and confirmed for association in two cohorts. These associations, if further validated may help identify those patients at risk for RHTN.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,005 | 0,007 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».