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Enregistrement W2895721938 · doi:10.1038/s41467-018-06517-2

A rapid rate of sex-chromosome turnover and non-random transitions in true frogs

2018· article· en· W2895721938 sur OpenAlexaff
Daniel L. Jeffries, Guillaume Lavanchy, Roberto Sermier, Michael J. Sredl, Ikuo Miura, Amaël Borzée, Lisa N. Barrow, Daniele Canestrelli, Pierre‐André Crochet, Christophe Dufresnes, Jinzhong Fu, Wen‐Juan Ma, Constantino Macı́as Garcı́a, Karim Ghali, Alfredo G. Nicieza, Ryan P. O’Donnell, Nicolas Rodrigues, Antonio Romano, Í‪ñigo Martínez-Solano, Ilona Stepanyan, Silvia Zumbach, Alan Brelsford, Nicolas Perrin

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Clinical Aspects of Sex Determination and Chromosomal Abnormalities
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesSwiss Institute of BioinformaticsSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungNational Science Foundation
Mots-clésBiologyChromosomeEvolutionary biologyGeneticsMutation rateSex linkageY chromosomeRecombinationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The canonical model of sex-chromosome evolution predicts that, as recombination is suppressed along sex chromosomes, gametologs will progressively differentiate, eventually becoming heteromorphic. However, there are numerous examples of homomorphic sex chromosomes across the tree of life. This homomorphy has been suggested to result from frequent sex-chromosome turnovers, yet we know little about which forces drive them. Here, we describe an extremely fast rate of turnover among 28 species of Ranidae. Transitions are not random, but converge on several chromosomes, potentially due to genes they harbour. Transitions also preserve the ancestral pattern of male heterogamety, in line with the 'hot-potato' model of sex-chromosome transitions, suggesting a key role for mutation-load accumulation in non-recombining genomic regions. The importance of mutation-load selection in frogs might result from the extreme heterochiasmy they exhibit, making frog sex chromosomes differentiate immediately from emergence and across their entire length.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations253
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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