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Enregistrement W2895856841 · doi:10.1139/cjps-2018-0189

Development of pre-breeding diploid potato germplasm displaying wide phenotypic variations as induced by ethyl methane sulfonate mutagenesis

2018· article· en· W2895856841 sur OpenAlexaffvenue
Ashok Somalraju, Kaushik Ghose, David Main, Benoît Bizimungu, Bourlaye Fofana

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Science · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Genetic and Mutation Studies
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMethane sulfonatePloidyBiologyGermplasmPolyploidPlant breedingSolanumHabitMutagenesisGenetic variationGenetic divergenceCultivarGeneHorticultureBotanyGeneticsMutantGenetic diversity

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutations are the key drivers for evolution and diversification in plants. In varietal selection, sources for variation are always sought as starting breeding materials. Thus, in the absence of desired natural variations in breeding populations, targeted or random mutagenesis is applied to induce variations. Cultivated potato (Solanum tuberosum L.) is autotetraploid crop species with a narrow and highly heterozygous genetic base, and the complexity of its genome makes its genetic studies more difficult. In the current study, induced mutagenesis was performed in diploid potato using ethyl methane sulfonate (EMS) to enlarge the genetic variability for its use as pre-breeding materials in both polyploid and diploid potato breeding. As starting materials, true potato seeds were treated with 1.2% EMS for 4–6 h along with untreated seeds as controls. A large variation in terms of germination rate, plant, flower, and tuber phenotype was observed in EMS-treated plants compared with their untreated counterparts. In particular, abnormal phenotypes including twisted stem, partial and (or) completely chlorotic leaves and stems, variations in stem colour and weak-stemmed plants with lateral growth habit as well as plants with determinate growth habit were observed along with normal plant characteristics. Moreover, variations in flower colour and tuber colour, shape, and size, as well as yield potential, were observed in EMS-treated lines. The reported phenotypic characterization of EMS mutagenized diploid potato collection is to our knowledge the first in its kind and represents a premium genetic resource for potato breeding programs and plant biologists for genes functional characterization in potato.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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