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Enregistrement W2896179149 · doi:10.1097/aci.0000000000000486

Very early onset IBD: novel genetic aetiologies

2018· review· en· W2896179149 sur OpenAlexafffund
Vritika Batura, Aleixo M. Muise

Notice bibliographique

RevueCurrent Opinion in Allergy and Clinical Immunology · 2018
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchLeona M. and Harry B. Helmsley Charitable Trust
Mots-clésMedicinePenetranceInflammatory bowel diseaseDiseaseMechanism (biology)Genome-wide association studyCrohn's diseaseEtiologyBioinformaticsImmunologyIntensive care medicineGeneticsPhenotypeGenePathologyGenotypeBiologySingle-nucleotide polymorphism

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE OF REVIEW: To summarize the current understanding and recent advances on the genetic aetiology in the pathogenesis of very early onset inflammatory bowel disease (VEO-IBD). RECENT FINDINGS: IBD is a chronic disorder of the gastrointestinal tract whose manifestation is a result of complex interactions between genetics, environment, immune system and microbial flora. Over 230 IBD risk loci have been reported in genome wide association studies but the genetic contribution of the majority of these loci in the manifestation of IBD is very low. Patients with VEO-IBD present with a more severe disease than older patients, characterized by poor prognosis and failure of conventional therapy. Recent studies have reported several monogenic diseases with high penetrance that present with IBD and IBD-like intestinal manifestations and overlap with primary immunodeficiencies. Increasing body of evidence supports a prominent role of genetics in the onset of VEO-IBD. New genetic variants and diagnoses in VEO-IBD are reviewed and current challenges in therapy with potential strategy to manage the disease are discussed. SUMMARY: Functional analysis of the genes implicated in monogenic IBD has increased the understanding of the underlying pathobiological mechanism of the disease. This knowledge can be used to personalize medicine for specific patients, improving the standard of care and quality of life.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,093
Tête enseignante GPT0,403
Écart entre enseignants0,309 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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