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Enregistrement W2896689037 · doi:10.1371/journal.pgen.1007643

Identification of UHRF2 as a novel DNA interstrand crosslink sensor protein

2018· article· en· W2896689037 sur OpenAlexfundno aff
Anna Motnenko, Chih‐Chao Liang, Di Yang, David López Martínez, Yasunaga Yoshikawa, Bao Zhan, Katherine E. Ward, Jiayang Tian, Wilhelm Haas, Paolo Spingardi, Benedikt M. Kessler, Skirmantas Kriaučionis, Steven P. Gygi, Martin A. Cohn

Notice bibliographique

RevuePLoS Genetics · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJohn Fell Fund, University of OxfordJapan Society for the Promotion of ScienceBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilLudwig Institute for Cancer ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFundación Mutua MadrileñaCancer Research UKWellcome TrustMedical Research CouncilRoyal SocietyWellcome
Mots-clésBiologyFANCD2ChromatinDNAGeneticsMolecular biologyCell biologyDNA repairFanconi anemia

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Fanconi Anemia (FA) pathway is important for repairing interstrand crosslinks (ICLs) between the Watson-Crick strands of the DNA double helix.An initial and essential stage in the repair process is the detection of the ICL.Here, we report the identification of UHRF2, a paralogue of UHRF1, as an ICL sensor protein.UHRF2 is recruited to ICLs in the genome within seconds of their appearance.We show that UHRF2 cooperates with UHRF1, to ensure recruitment of FANCD2 to ICLs.A direct protein-protein interaction is formed between UHRF1 and UHRF2, and between either UHRF1 and UHRF2, and FANCD2.Importantly, we demonstrate that the essential monoubiquitination of FANCD2 is stimulated by UHRF1/UHRF2.The stimulation is mediating by a retention of FANCD2 on chromatin, allowing for its monoubiquitination by the FA core complex.Taken together, we uncover a mechanism of ICL sensing by UHRF2, leading to FANCD2 recruitment and retention at ICLs, in turn facilitating activation of FANCD2 by monoubiquitination. Author summaryFanconi Anemia is a genetic disease where patients typically have congenital abnormalities, develop bone marrow failure and suffer from cancer predisposition.The cells in patients have a reduced ability to repair a type of DNA damage where the two strands of the DNA double helix are physically linked together, and this failure in repair is believed to contribute to cause of the disease.Many proteins are involved in repairing this type of DNA damage in healthy individuals, via a complex DNA repair pathway called the Fanconi Anemia pathway.Here, we report the identification of a new player in this pathway.The protein, called UHRF2, is able to sense the DNA damage in the genome, and thereby help to initiate the healthy repair of the damage.In addition to improving our molecular

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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