2064. Rapid Detection of Carbapenmase-Producing <i>Klebsiella pneumoniae</i> (CPK) Directly from Respiratory Secretion and Clinical Characteristics of Patients with CPK from a 1,200-Bed Tertiary Care Hospital in Thailand
Notice bibliographique
Résumé
There is an unmet need for rapid detection of carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae (CPK) for patient care and infection control. The BD MAX™ CRE (automated PCR, Geneohm, Canada) test is the fully automated sample-to-result platform for detection of resistance genes, blaKPC, blaOXA-48 and blaNDM within 2 hours. It has been validated for using with colonies and rectal swab. We aimed to evaluate its performance for detection of carbapenemases genes directly from respiratory samples of the patients whom K. pneumoniae (KP) were identified. A total of 169 KP isolates and respiratory samples were collected from patients admitted to King Chulalongkorn Memorial Hospital, Bangkok, Thailand from June 2017 to December 2017. The automated PCR test was performed directly from respiratory specimens. The results were compared with in-house PCR for detection of carbapenemase genes performed on KP colonies isolated from respiratory specimens as our reference method. Patient and clinical characteristics between patients with CPK and non-CPK were also analyzed. The prevalence of CPK was 10.6% (18/169 isolates). The automated PCR test had 91.12% accuracy, 66.7% sensitivity (95% CI, 40.9–86.6), 94.0% specificity (95% CI, 88.9–86.6), 57.1% positive predictive value (95% CI, 39.5–73.1) and 95.9% negative predictive value (95% CI, 92.48–97.85). Of 18 isolates, blaOXA-48 was the most common carbapenemase gene (17 isolates; 94.4%), followed by blaNDM-1 (7 isolates; 38.9%). A combination of blaOXA-48 and blaNDM-1 was detected in 6 isolates (33.3%). There were 7 (38.8%) colonizations and 11 (61.1%) infections. The significant risk factors for CPK included post-surgery (P = 0.04) and prior antibiotics exposure (P = 0.04). There was a trend toward higher mortality in patients with CPK albeit not significantly (33% vs. 24.5%, P = 0.41). The automated PCR test has an acceptable accuracy with fair sensitivity for the detection of carbapenemase genes. It is unique that OXA-48 and OXA-48/NDM-1 are the most common carbapenemases in our institute. This diagnostic test may be use for rapid diagnosis or infection control purposes. Exposure to antibiotics associated with colonization or infection with CPK. Patients with CPK had higher mortality. All authors: No reported disclosures.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».